Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik
Offener Zugang

Abstrakt

Eine genombasierte Entdeckung des S. mansoni-Sekretoms zur Identifizierung therapeutischer Ziele

Mandage RH, Jadhavrao PK, Wadnerkar AS, Varsale AR und Kurwade KK

Die Motivation hinter der groß angelegten Genomanalyse von S. mansoni bestand darin, die Möglichkeit zu erkunden, das Sekretom zu entdecken, das häufig an der Schnittstelle zwischen Parasit und Wirt abgesondert wird und vermutlich eine entscheidende Rolle beim Parasitismus spielt, indem es die Immunreaktion unterdrückt und die Ausbreitung der Infektiosität unterstützt. Hier präsentieren wir eine effiziente Pipeline bioinformatischer Methoden zur Identifizierung von Kandidatenproteinen für Parasitismus im Sekretom von S. mansoni, das Immunreaktionen im infizierten Wirt hervorruft. Die 3.700 aus dem Genom von S. mansoni abgeleiteten Proteine ​​wurden auf das Vorhandensein oder Fehlen von sekretorischen Signalpeptiden untersucht. Wir identifizierten 32 Proteine, die ein N-terminales sekretiertes Signalpeptid tragen, denen jedoch zusätzliche membranverankernde Einheiten fehlen. Insbesondere identifizierten wir Proteine, die an der ATP-Synthese, dem Redoxgleichgewicht, der Proteinfaltung, der Gluconeogenese, der Entwicklung und Signalisierung, der Beseitigung und den Stoffwechselwegen der Nukleotide sowie der Modulation der Immunreaktion beteiligt sind. Die meisten dieser Proteine ​​definieren ihr Potenzial für die immunologische Diagnose und Impfstoffentwicklung. Hier wurde ein systematischer Versuch unternommen, eine allgemeine Methode zur Vorhersage von Sekretproteinen eines Parasiten mit hoher Effizienz und Genauigkeit zu entwickeln.