Zeitschrift für Nanomedizin und biotherapeutische Entdeckung
Offener Zugang

Abstrakt

Bioinsilico-Analyse der c-MYC-Genassoziation mit Burkitt

Enas Abdalla Mohammed Ahmedon

Hintergrund : Das MYC-Gen ist ein wichtiger proto-onkogener Transkriptionsfaktor und kodiert ein nukleäres Phosphoprotein für zentrale zelluläre Prozesse. Eine gestörte Expression oder Funktion von c-MYC ist eine der häufigsten Anomalien bei menschlichen Krebserkrankungen. Das normale c-MYC-Gen ist in drei separaten Exons kodiert, die durch zwei große dazwischenliegende Sequenzen getrennt sind. In dieser Studie konzentrierten wir uns auf die Erkennung von Einzelnukleotidpolymorphismen (SNPs) im MYC-Gen, die mit der Entstehung des Burkitt-Lymphoms in Zusammenhang stehen, und darauf, den Zusammenhang der meisten gemeldeten SNPs mit der Krankheit zu bestätigen oder auszuschließen sowie neue Mutationen zu erkennen, die mit der Erkrankung in Zusammenhang stehen.

Materialien und Methoden: Das MYC-Gen wurde in der NCBI-Datenbank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) untersucht und die SNPs wurden mithilfe von Computersoftware analysiert. SNPs in der codierenden Region (exonale SNPs), die nicht synonym sind (nsSNP), wurden mithilfe der Software (Sift, Polyphen2, I-Mutant, SNPs&GO und PHD-SNP) analysiert.

Ergebnis: Wir haben 2868 SNPs von (NCBI) analysiert, 286 davon wurden bei Homo sapiens gefunden, 48 davon wurden weiter untersucht. Schlussfolgerung: Acht SNPs wurden gemäß den vier verwendeten Softwareprogrammen als die krankheitsverursachendsten angesehen (rs4645959, rs4645959, rs141095253, rs141095253, rs150308400, rs150308400, rs150308400, rs150308400). Zwei davon wurden bisher nicht gemeldet [rs4645959 (N25S), rs141095253 (P396L)].