Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik
Offener Zugang

Abstrakt

Charakterisierung und Strukturdynamik differentiell exprimierter Proteine ​​des Probiotikums Eschericia coli Nissle 1917 als Reaktion auf den Saft von Cocos nucifera

Chandrasekhar K, Sreedevi B, Sreevani S, Dileep A, Lebonah D, Seshapani P und Pramoda kumari J

Das Ziel der vorliegenden Studie war, die exprimierten Proteinstrukturen als Reaktion auf mit Cocoti-Saft behandeltes Probiotikum E. coli Nissle 1917 mittels MALDI-TOF-MS zu bewerten und zu analysieren. Die exprimierten Proteinspots wurden mittels 2D-Gelelektrophorese getrennt und für die MALDI-Analyse mit dem Enzym Trypsin verdaut. Die exprimierten Proteinsequenzen wurden anhand ihres Masse-Ladungs-Verhältnisses aus Mascot-Suchdaten gesammelt. Die Sequenzen werden mit der Software Phyre-2 zur Homologiemodellierung analysiert. Die vorhergesagten Strukturen wurden zudem mit der Software Rampage validiert. Von den exprimierten Proteinen zeigten nur fünf Proteine ​​eine gute strukturelle Validierung in mit Saft behandelten Probiotika. Es wurde der Schluss gezogen, dass die exprimierten Proteinprofile mittels 2D-PAGE und MALDI analysiert wurden, um die Stressmechanismen des Cocoti-Safts im Probiotikum E. coli Nissle 1917 zu verstehen. Stressmechanismen induzieren viele Proteine, die an Stoffwechselprozessen beteiligt sind, die Genexpression, SOS-Regulierung, Transferaseaktivität, den Purinstoffwechsel und andere damit verbundene Aktivitäten regulieren.