Klinische Pädiatrie: Offener Zugang
Offener Zugang

Abstrakt

Zirkulierende Y-RNAs: Eine vorhergesagte Funktion hauptsächlich bei der Kontrolle des angeborenen Immunsystems, der Zellsignalisierung und der DNA-Replikation bei pädiatrischen Patienten mit pilozytischem und diffusem Astrozytom

Juan Manuel Rodríguez-Corona, Ruth Ruiz Esparza-Garrido, Jorge Víctor Horta Vega Miguel, Angel Velazquez Flores

Hintergrund: Y-RNAs sind kleine nicht-kodierende RNAs, die erstmals bei Patienten mit Sjögren-Syndrom und Lupus erythematodes identifiziert wurden und unterschiedliche zelluläre Funktionen haben. Y-RNAs sind sehr häufig im Serum vorkommende ncRNAs und nur wenige sind hinsichtlich ihrer molekularen Rolle bekannt.

Ziel: Ziel der Studie war es, den Ausdruck zirkulierender Y-RNAs im Blutserum von pädiatrischen Patienten mit pilozytischem oder diffusem Astrozytom zu bestimmen.

Materialien und Methoden: Die Expression von Y-RNAs wurde mithilfe des Human Transcriptome Array (HTA) 2.0-Arrays bestimmt. Darüber hinaus wurde eine bioinformatische Annäherung der möglichen biologischen Funktionen von Y-RNAs mithilfe der Algorithmen Random Forest (RF) und Vector Support Machine (VSM) ermittelt.

Ergebnisse: Die Daten zeigten eine differenzielle Expression von RNY-3, RNY-4 und RNY-5 bei pädiatrischen Patienten mit Astrozytom im Vergleich zur Kontrollgruppe. Gleichzeitig zeigte sich, dass RNY-1 im diffusen Zustand im Vergleich zum pilozytischen Zustand hochreguliert ist. Die bioinformatische Analyse zeigte, dass RNY-4 und RNY-5 die höchsten Interaktionswerte mit Claudin, Toll-like-Rezeptoren und Hyaluronidase-1 aufwiesen. Darüber hinaus wies die Y-RNA-Loop-Domäne selbst den höchsten Interaktionswert mit dem B-Zell-Rezeptor CD22 (RNY-3) und den Toll-like-Rezeptoren 7 und 3 (RNY-4) auf.

Schlussfolgerung: Unsere Ergebnisse zeigten zum ersten Mal eine differenzielle Expression zirkulierender Y-RNAs in pädiatrischen Astrozytomen. Dies ermöglicht es, pädiatrische Probanden ohne Krebs von Patienten mit pädiatrischem diffusem oder pilozytischem Astrozytom zu unterscheiden und ihre potenzielle Beteiligung an der Regulierung verschiedener biologischer Prozesse wie Immunaktivierung/-unterdrückung, Zellsignalisierung, selektiver Transkription und Zellproliferation durch Aktivierung der DNA-Replikation zu unterscheiden.