Zeitschrift für antivirale und antiretrovirale Medikamente
Offener Zugang

Abstrakt

Vergleichende Studie zur phylogenetischen Analyse des S1- Gens von Isolaten des infektiösen Bronchitisvirus aus dem Irak mit den ausgewählten Stämmen (Genbank)

Noor R Abady*, Firas.Al-bawi

Erst kürzlich, im Jahr 2018, wurden vier Stämme des Virus der infektiösen Bronchitis (IBV) aus geimpften und nicht geimpften Masthähnchenherden aus verschiedenen Hühnerfarmen in verschiedenen Städten im Irak isoliert. Die pathogenen Eigenschaften der vier IBV-Stämme wurden untersucht. Testhühner wurden mit den vier Stämmen infiziert, woraufhin eine Immunreaktion ausgelöst wurde. Kreuzneutralisationstests ergaben bemerkenswerte Ergebnisse, die zeigten, dass sich die Stämme antigenisch von den klassischen IBV-Stämmen H120, M41, Conn und Gray unterschieden. Im Vergleich zum Impfstamm H120 traten an vielen Stellen im S1-Protein der vier Stämme kurze Insertionen, Punktmutationen und Deletion auf. Zwei der vier Stämme wiesen das Motiv (HRRRR) auf, das als identisch mit dem der epidemischen IBV-Stämme im Irak angesehen wurde. Bei zwei weiteren Stämmen traten in den isolierten Stämmen neue Motive (HRLRR und RRYRR) auf. Diese vier Stämme unterschieden sich auch genetisch von den Impfstoffstämmen und nicht-irakischen IBV-Stämmen, waren jedoch eng mit einer großen Zahl von Stämmen aus den USA, China, Singapur und Indien verwandt. Die Isolate und 14 Referenz-IBV-Stämme wurden in drei verschiedene Gruppen (I-III) gruppiert. Die vier Stämme wurden in Gruppe III kategorisiert und bilden einen großen phylogenetischen Zweig, der eng mit IBVs aus den USA und Singapur verwandt ist, während die Impfstoffstämme der Gruppen I und II genetisch von den Gruppen III entfernt sind. Die Ergebnisse dieser Studie zeigen, dass in der Hühnerpopulation im Irak unterschiedliche IBV-Stämme zirkulieren.