Zeitschrift für Physikalische Chemie und Biophysik
Offener Zugang

Abstrakt

Umfassende vergleichende Analyse der morphologischen Veränderungen in einem 12-mer DNA-Oligonukleotid nach Platinierung mit Cisplatin, Oxaliplatin und BNP3029 (einem substituierten Cyanoliganden-basierten Platinanalogon) unter Verwendung von Molekulardynamik-Simulationsstudien

Pavankumar PNV, Ayala PY, Parker AR, Zhao M, Jair K, Chen X, Kochat H und Hausheer FH

Cisplatin ist ein wichtiges, in der Klinik weit verbreitetes Mittel gegen Krebs; es weist jedoch mehrere erhebliche Einschränkungen auf. Bei der Entwicklung neuer Platinanaloga wurden Schlüsseleigenschaften berücksichtigt, die zu wirksameren Platinanaloga führen könnten. In dieser Studie präsentieren wir umfassende molekulardynamische Simulationsstudien unter Verwendung eines 12-mer-DNA-Oligonukleotids (5'-CCTCTggTCTCC-3', gg = Platinierungsstelle), das mit Cisplatin (1), Oxaliplatin_1R_2R (2) und BNP3029 (3, ein neues substituiertes Cyanoplatinalogon, PtCl2[N≡C(CH2)3(C6H5)]2) platiniert wurde, und analysierten die große Datenmenge mithilfe der Kolmogorov-Smirnov-Statistikanalyse. Zusammenfassend wiesen die Daten darauf hin, dass BNP3029-DNA im Vergleich zu Cisplatin-DNA und Oxaliplatin-DNA eine weniger A-ähnliche DNA-Morphologie aufwies und somit eine eher B-ähnliche DNA-Form beibehielt. BNP3029 zeigte im Vergleich zu Cisplatin und Oxaliplatin eine stärkere zytotoxische Aktivität in einer Vielzahl menschlicher Krebszelllinien, darunter auch mehrere platinresistente Zelllinien.