Arzneimitteldesign: Offener Zugang
Offener Zugang

Abstrakt

Konformationssuche nach der Struktur von Tripeptiden mittels Molekulardynamik: Untersuchung von L,L-Gly-Phe-Phe, L,L-Phe-Gly-Phe und L,L-Phe-Phe-Gly

Khebichat N, Nekkaz K, Ghalem S, Sajid Rashid und

Natürliche Oligopeptide bestehen aus 2-50 Aminosäureresten und kommen in praktisch allen lebenden Organismen vor.
Obwohl mehrere Funktionen dieser Peptide bekannt sind, muss die genaue Art der mechanistischen Aktivität durch die Analyse konformationeller und struktureller Details ermittelt werden. In dieser Studie haben wir eine Konformationsanalyse mithilfe einer molekulardynamischen (MD) Simulation durchgeführt, um das dynamische Verhalten von drei Tripeptiden zu untersuchen: L,LGly-Phe-Phe (kommerziell), L,L-Phe-Gly-Phe und L,L-Phe-Phe-Gly in einem expliziten Wassermodell.