ISSN: 2379-1764
Balaji S. Rao, Krishna Kant Gupta, Suchitra Kumari, Ankit Gupta und K. Pujitha
Antipeptide oder hemmende Peptide haben zum Ziel, die Interaktion zwischen Virus und Korezeptor zu verhindern. In dieser Studie wurde ein Datensatz HIV-hemmender Peptide aus der HIPdb-Datenbank verwendet. In der HIPdb-Datenbank sind 110 HIV-hemmende Peptide vorhanden. Es wurde ein Multiple Sequence Alignment (MSA) aller insgesamt 110 Antipeptide durchgeführt und einige der am besten konservierten Antipeptide ermittelt. Als nächstes wurde eine Methode zur Vorhersage der Antigenität verwendet, um die maximale Antigenität der 14 konservierten hemmenden Peptide zu ermitteln. Alle Peptide wurden auf Hydrophobie untersucht, da geringe Hydrophobie eine humoral vermittelte Immunität induziert. Anschließend wurden eine antimikrobielle Peptidvorhersage (AMP) und ihre Klassifizierung durchgeführt. In dieser Studie sind PWQGGRRKFR und KYRRFRWKFK die vielversprechenden HIV-Antipeptide zur AIDS-Behandlung. Diese Studie wird Wissenschaftlern helfen, die Forschung für ein besseres Verständnis der HIV-Behandlung in Form der Medikamenten- und Impfstoffentwicklung voranzutreiben.