Immunomforschung
Offener Zugang

Abstrakt

Data Mining bei Krebsimpfstoffstudien: eine Vogelperspektive

Karen B Maloney und Vladimir Brusic

Hintergrund: Öffentlich zugängliche Online-Register bieten eine Fülle von Informationen zu klinischen Studien. Informationstechnologie und Datenaustauschstandards ermöglichen eine schnelle Extraktion, Zusammenfassung und Visualisierung von Informationen und abgeleitetem Wissen aus diesen Datensätzen. Daten zu klinischen Studien wurden im XML-Format von der Website ClinicalTrials.gov der National Library of Medicine extrahiert. Diese Daten umfassen Kategorien wie „Zusammenfassung des Zwecks“, „Studiensponsor“, „Phase der Studie“, „Rekrutierungsstatus“ und „Standort“. Wir konzentrierten uns auf 645 klinische Studien zu Krebsimpfstoffen. Zusätzliche Fakten zu Krebsarten, einschließlich Inzidenz und Überlebensraten, wurden aus den Überwachungsdaten des National Cancer Institute abgerufen. Ergebnisse: Diese Anwendung ermöglicht eine schnelle Extraktion von Informationen über Institutionen, Krankheiten, klinische Ansätze, Daten klinischer Studien, vorherrschende Krebsarten in den Studien, klinische Möglichkeiten und Abdeckung des Pharmamarkts. Die Präsentation der Ergebnisse wird durch Visualisierungstools erleichtert, die den Überblick über laufende und abgeschlossene Krebsimpfstoffstudien zusammenfassen. Unsere Zusammenfassungen zeigen die Anzahl klinischer Impfstoffstudien pro Krebsart, im Zeitverlauf, nach Phase, nach Hauptsponsoren sowie die Studienaktivität im Verhältnis zu Krebsart und Überlebensdaten. Wir haben auch Krebsarten identifiziert, die im Bereich der Krebsimpfstoffe vernachlässigt werden: Blasenkrebs, Leberkrebs, Bauchspeicheldrüsenkrebs, Magenkrebs, Speiseröhrenkrebs und alle Krebsarten mit geringer Inzidenz. Fazit: Wir haben einen Data-Mining-Ansatz entwickelt, der eine schnelle Extraktion komplexer Daten aus dem wichtigsten Repository für klinische Studien ermöglicht. Die Zusammenfassung und Visualisierung dieser Daten stellt ein kostengünstiges Mittel dar, um fundierte Entscheidungen über zukünftige klinische Studien zu Krebsimpfstoffen zu treffen.