ISSN: 2471-9315
Fatah Tazerart, Jamal Saad, Muriel Militello, Sophie Alexandra Baron, Michel Drancourt*, Sylvain Godreuil*
Eine bronchoalveoläre Lavageprobe wurde mittels Bronchoskopie von einem 25-jährigen männlichen kambodschanischen Patienten mit Verdacht auf klinische Tuberkulose entnommen und in Löwenstein-Jensen-Medium inokuliert. Kolonien eines schnell wachsenden, nicht chromogenen grampositiven und säurefesten Bakteriums wurden untersucht. Rasterelektronenmikroskopie zeigte 1,2 ± 0,29 μm lange und 0,58 ± 0,07 μm große Bazillen, die mit routinemäßiger Matrix-unterstützter Laserdesorptions-Ionisations-Flugzeit-Massenspektrometrie und phänotypischen Tests (API ® ZYM, API ® Coryne und Biolog ® Phenotype MicroArray-Tests) nicht identifiziert werden konnten. In vitro war das Isolat empfindlich gegenüber Isoniazid, Amikacin und Trimethoprim-Sulfamethoxazol. Die Sequenzierung des gesamten Genoms ergab ein 5.703.981 bp umfassendes vorläufiges Genom, das 69,3 % GC-Gehalt mit 5.207 codierenden Proteingenen und 56 vorhergesagten RNA-Genen, darunter 3 rRNAs, aufwies. Die rpoB-Sequenz wies eine Sequenzähnlichkeit von 93 % mit der von Mycobacterium parascrofulaceum im Mycobacterium simiae-Komplex auf. Aus der Genomsequenz abgeleitete DNA-DNA-Hybridisierung, OrthoANI und pangenomische Analysen bestätigten, dass dieses Isolat eine unbeschriebene Art innerhalb des M. simiae-Komplexes darstellte. Diese Art wurde nach ihrer Isolationsquelle Mycobacterium cambodiensis genannt. Das Isolat wurde in der Collection de Souches de l'Unité des Rickettsies (CSUR) unter der Nummer CSURP9652 hinterlegt.