Zeitschrift für antivirale und antiretrovirale Medikamente
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Abstrakt

Nachweis eines neuartigen Coronavirus (SARS-CoV-2) mittels Reverse-Transkription-Polymerase-Kettenreaktion in Echtzeit, China, 2020

Huahua Feng, Honglong Wu, Huagui Wang, Jianying Yuan, Lu Chen, Hui Jin, Lingling Yang, Jinyin Zhao*, Licheng Liu*, Weijun Chen*

Hintergrund: Während des Ausbruchs einer ungeklärten Lungenentzündung in der Stadt Wuhan Ende Dezember 2019 wurde ein neuartiges Coronavirus namens SARS-CoV-2 als Ursache dieses Ausbruchs identifiziert.

Methoden: Zur Erkennung und Identifizierung von SARS-CoV-2 wurde eine Echtzeit-Polymerase-Kettenreaktion entwickelt, die auf das orf1ab-Gen des Virusgenoms abzielt. Mit diesem Test untersuchten wir 309 Proben von Personen mit Verdacht auf eine SARS-CoV-2-Infektion in Wuhan. Dabei wurden 6 eng phylogenetische Coronaviren und 7 Viren nachgewiesen, die eine Lungenentzündung verursachen können. Darüber hinaus wurden 57 mit anderen Viren infizierte klinische Proben sowie 77 gesunde Proben getestet.

Ergebnisse: Die Nachweisgrenze des Tests lag bei 6,25 Kopien pro Reaktion beim Nachweis von in vitro transkribierter cRNA . Die Ergebnisse des Nachweises von Rachen- und Stuhlabstrichen von Personen mit Verdacht auf eine SARS-CoV-2-Infektion zeigten, dass Rachenabstriche in den ersten 15 Tagen nach Symptombeginn sensitiver waren als Stuhlabstriche (Rachen: 56,80 %, Stuhl: 30,43 %), während sich die Situation nach 15 Tagen umkehrte (Rachen: 20,83 %, Stuhl: 27,58 %). Und Matched-Pair-Tests deuteten darauf hin, dass die Sputumproben eine höhere Viruslast aufwiesen als die Rachenabstriche der Patienten (P<0,05). Es gab keine Kreuzreaktion, als wir die inaktive Kultur von sechs anderen Coronaviren (humanes Coronavirus 229E, NL63, OC43, HKU1, SARS-CoV, MERS-CoV) und sieben anderen Viren (Influenzavirus A H1N1, Influenzavirus A H3N2, Influenzavirus B, Parainfluenzaviren 1, 2 und 3 sowie respiratorisches Synzytialvirus) entdeckten. Außerdem waren 27 BALF-Proben von Lungenentzündungspatienten, die mit dem humanen Coronavirus 229E, OC43, HKU1 oder dem humanen Adenovirus 7 infiziert waren, 30 Rachenabstriche von Patienten, die mit H1N1 infiziert waren, und 77 Rachenabstriche von gesunden Menschen bei diesem Test negativ.

Schlussfolgerung: Die Ergebnisse zeigten, dass der Test SARS-CoV-2 spezifisch und empfindlich erkannte.