Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik

Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik
Offener Zugang

ISSN: 0974-276X

Abstrakt

Effizientes Mining von Genexpressionsdaten mittels neuartiger binärer Biclustering-Algorithmen

Haifa Ben Sabre und Mourad Elloumi

In diesem Artikel präsentieren wir vier neue Algorithmen namens BiBin Alter, BiBin Cons und BiBin Sim zum Biclustering von binären Microarray-Daten. Es gibt neuartige Alternativen, um Bicluster aus spärlichen binären Datensätzen zu extrahieren. Unsere Algorithmen basieren auf den Ansätzen Iterative Row and Column Clustering Combination (IRCCC) und Divide and Conquer (DC), Bi Max-Initialisierung und der Cro Bin-Auswertungsfunktion. Angewandt auf binäre synthetische Datensätze übertreffen unsere Algorithmen andere Biclustering-Algorithmen für binäre Microarray-Daten. Bicluster mit unterschiedlichen Zeilen- und Spaltenzahlen können erkannt werden, die von vielen Zeilen bis zu wenigen Spalten und von wenigen Zeilen bis zu vielen Spalten variieren. Unsere Algorithmen ermöglichen es dem Benutzer, die Suche auf Bicluster mit bestimmten Dimensionen auszurichten.

Haftungsausschluss: Diese Zusammenfassung wurde mithilfe von Tools der künstlichen Intelligenz übersetzt und wurde noch nicht überprüft oder verifiziert.
Top