Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik
Offener Zugang
ISSN: 0974-276X
ISSN: 0974-276X
Keiichi Izumikawa, Hideaki Ishikawa, Harunori Yoshikawa, Goro Terukina, Naoki Miyazawa, Hiroshi Nakayama, Yuko Nobe, Masato Taoka, Yoshio Yamauchi, Sjaak Philipsen, Toshiaki Isobe und Nobuhiro Takahashi
SMN-Komplexe (Survival Motor Neuron Protein) sind für die Biogenese uridinreicher kleiner nukleärer Ribonukleoproteine (UsnRNPs) unerlässlich. Während der Biogenese werden die an UsnRNPs gebundenen SMN-Komplexe vom Zytoplasma in den Zellkern transportiert und in den Cajal-Körper (Körper)/Gems (Cajal/Gems) verschoben, wo die SMN-Komplexe-UsnRNPs weiteren chemischen Modifikationen unterzogen und in die SMN-Komplexe und die reifen UsnRNPs dissoziiert werden. Obwohl die reifen UsnRNPs in den Perichromatinfibrillen am Chromatin mit neu transkribierter prä-mRNA zu Spleißosom zusammengesetzt werden, bleibt die Rolle der dissoziierten nukleären SMN-Komplexe unbestimmt. In dieser Studie haben wir Friend of Prmt1 (FOP; Chromatinziel von Prmt1, CHTOP; C1orf77) als neuen Bestandteil der nuklearen SMN-Komplexe durch Biotinaffinitätsreinigung in Verbindung mit Proteinidentifizierung auf Basis von Massenspektrometrie identifiziert. FOP war mit SMN, Gemines 2, 3, 4, 6 und 8, unrip und Fragile X Mental Retardation 1 Protein (FMR1) sowie mit U5- und U6-snRNAs im Zellkern assoziiert, jedoch nicht mit Sm-Proteinen, Gemin5, Coilin und U1- und U2-snRNAs. Mithilfe der quantitativen proteomischen Methode mit SILAC in Verbindung mit RNA-Interferenz haben wir außerdem gezeigt, dass FOP für die Assoziation der SMN-Komplexe mit hnRNPs, Histonproteinen und verschiedenen RNA-bindenden Proteinen erforderlich ist. Es wird berichtet, dass FOP sich hauptsächlich in den Kernflecken lokalisiert, Chromatin bindet und eine Rolle bei der mRNA-Transkriptionsregulierung spielt. Unsere aktuellen Daten legen nahe, dass der nukleäre SMN-Komplex, der FOP enthält, am Prozess der posttranskriptionellen mRNA-Regulierung beteiligt ist.