ISSN: 1948-5964
Valinciute A, Kiveryte S und Mauricas M
Hintergrund: Das GB-Virus C (GBV-C), auch bekannt als Hepatitis-G-Virus (HGV), ist ein umhülltes Virus mit einem einzelsträngigen RNA-Genom von etwa 9,4 kb Länge. Aufgrund der Ähnlichkeit der Genomstruktur mit HCV wird das GBV-C-Virus als Virus der Familie der Flaviviridae klassifiziert. Das GBV-C-Virus ist weltweit verbreitet und Virusinfektionen kommen sowohl bei gesunden Blutspendern als auch bei immungeschwächten Personen häufig vor. Frühere Studien zeigten eine hohe GBV-C-Koinfektionsrate bei Personen, die mit dem Hepatitis-C-Virus (HCV) und dem Humanen Immundefizienz-Virus (HIV) infiziert sind. Aufgrund genetischer Unterschiede zwischen den 5'-untranslatierten Regionen (5'UTR) der GBV-C-Isolate wird das Virus in sieben Hauptgenotypen und mehrere Subtypen eingeteilt. Die Verbreitung der GBV-C-Genotypen ist geografisch unterschiedlich und die Informationen sind noch unvollständig. Das Ziel dieser Studie war, die Häufigkeit von GBV-C und der GBV-C-Genotypen unter HCV-positiven Personen in Litauen zu bestimmen.
Methoden: In dieser Studie wurde GBV-C-RNA aus Serumproben von 170 Patienten mit bekannter HCV-Infektion isoliert. Die verschachtelte Reverse-Transkriptase-Reaktion wurde verwendet, um die komplementäre DNA (cDNA) zu synthetisieren und das Fragment von 210 bp aus der 5'UTR-Region wurde durch verschachtelte RT-PCR amplifiziert. Die PCR-Produkte wurden sequenziert und einer phylogenetischen Analyse unterzogen, indem Referenzsequenzen von jedem Genotyp verwendet wurden, die von GenBank erhalten wurden (n=46). Die Analyse wurde mit CLC bio Version 6.6.5 und MEGA 5.2 berechnet.
Ergebnisse: Unter 170 HCV-positiven Patienten waren 36 (21,17%) positiv für GBV-C. Basierend auf der phylogenetischen Analyse einer kurzen Region (210 bp) in der 5'UTR-Region wurden zwei Genotypen, 2a und 3, klassifiziert.
Schlussfolgerungen: In dieser Studie wurde eine hohe Häufigkeit des GBV-C-Genotyps 2a bei litauischen HCV-positiven Patienten festgestellt. Das Vorhandensein des Genotyps 3 kann mit der geografischen Lage und Geschichte Litauens korreliert sein.