Transkriptomik: Offener Zugang
Offener Zugang

Abstrakt

Genetische Diversität bei Gurken durch Verwendung von Inter Simple Sequence Repeats (ISSR)

Singh DK, Rajani Tewari, Singh NK und Shashank S Singh

Gurken sind ein wichtiges, weltweit angebautes Gemüse. Genetische Vielfalt und Ähnlichkeit zwischen 11 Gurkengenotypen, nämlich PCUCP-2, PCUCP-3, Nun-3139, Nun-3121, Nun-3141, Infinity, Isatis und Kian sowie PCUC-8, PCUC-15 und PCUC-28, wurden unter Treibhausbedingungen an der GB Pant University of Agriculture and Technology in Pantnagar gebaut. Von jedem Genotyp wurden frische und junge Blätter gesammelt. Die Blätter wurden in kleine Stücke geschnitten und mit flüssigem Stickstoff zu Pulver gemahlen. Genomische DNA wurde dann unter Verwendung der modifizierten CTAB-Methode isoliert. Die genetische Vielfalt und Ähnlichkeit wurde unter Verwendung von 8 ISSR-Markern geschätzt. Die 6 ISSR-Primer erzeugen insgesamt 49 polymorphe Allele. Auf der Grundlage der ISSR-Daten gruppierte ein Dendrogramm die Genotypen in zwei Hauptcluster und fünf Untercluster. Unter allen Genotypen wurde insgesamt ein Polymorphismus von 40 – 100 % beobachtet. Die Anzahl der von verschiedenen Primern erzeugten Allele lag zwischen 5 und 14, mit einem Durchschnitt von 9,5 Allelen pro Primer, und der Grad des Polymorphismus betrug 88,88 %. Der Ähnlichkeitswert lag zwischen 35 % und 96 %. Drei monoziöse Genotypen, nämlich PCUC-8, PCUC-15 und PCUC-28 (Pant Khira-1), wurden in einem Cluster mit 96 % Ähnlichkeit gruppiert, während parthenokarpe Genotypen in einem anderen Cluster zusammengefasst wurden. Daher wird der Schluss gezogen, dass die Charakterisierung und Bestimmung der Diversität zwischen Parthenokarpen und monoziösen Gurken abgeschlossen ist. Diese Informationen können zur Formulierung eines effizienten Zuchtprogramms für Gurken verwendet werden.