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Abstrakt

Genomics 2019: Transkriptomanalyse von HPV-induzierten Warzen und gesunder Haut beim Menschen: Eine explorative Studie

Laith N. Al-Eitan

Die humanen Papillomviren (HPV) sind als Ursache für Muttermale beim Menschen bekannt. Es handelt sich um eine ansteckende Gruppe von DNA-Viren, die durch Hautkontakt zwischen Menschen übertragen werden. Da Muttermale bei 7 bis 12 % der Bevölkerung vorkommen, ist eine HPV-Infektion eine relativ häufige Krankheit, die etwa 1 von 10 Menschen im Laufe ihres Lebens befällt. Nach einer umfassenden Überprüfung der aktuellen Literatur wurde festgestellt, dass keine Arbeiten die qualitativen Expressionsprofile von HPV-induzierten Muttermalen untersuchten. Der Hauptzweck dieser Untersuchung besteht darin, festzustellen, ob es bei HPV+-Personen einen Unterschied in den qualitativen Expressionsprofilen von Muttermalen und gesunder Haut gibt. Zum ersten Mal wurde in Jordanien die RNA-Sequenzierungstechnologie eingesetzt, um festzustellen, ob es einen Unterschied in der qualitativen Expression zwischen HPV-induzierten Muttermalen und gesunder Haut gibt. Korrelationen zwischen HPV-induzierten Muttermalen und gesunder Haut von jordanischen arabischen Patienten wurden mithilfe des Illumina HiSeq 2500-Sequenzierungssystems durchgeführt. Zur Messung der differentiellen Kommunikation, zur Analyse der Verbesserung von Gensätzen, zur Pathway-Analyse und zur Heatmap-Bündelung wurden verschiedene bioinformatische Programme verwendet. Es wurde festgestellt, dass HPV-induzierte Muttermale ein sehr großes und einzigartiges genetisches Merkmal aufweisen. Viele der nach oben gerichteten Gene wurden mit Krebs und Infektionen in Verbindung gebracht (WIF1, HMGCS2, CLU und PTGIS), während einige nach unten gerichtete Gene mit einer Pathway-Behinderung in Verbindung gebracht wurden (SPINK6, PI3, SERPINB4, SERPINB3). Außerdem wurde festgestellt, dass die 500 am häufigsten differentiell kommunizierten Gene mit Immun- und Immunsystem-Pathway-Signalwegen in Verbindung stehen, wie z. B. die Neutrophilendegranulation, der TLR-7/8-Pathway (TLR 7/8), der TLR-9-Pathway und der TLR-10-Pathway (TLR10). HPV-induzierte Muttermale haben ein unverwechselbares Merkmalsausprägungsmuster, das sie von gesunder Haut unterscheidet, aber viele Gemeinsamkeiten mit anderen Hautkrankheiten hat. Zukünftige Forschungslinien müssen die in dieser Untersuchung aufgedeckten Merkmale individuell untersuchen, um den Grad ihrer Pathogenität zu bestimmen.

The human papillomavirus (HPV) is a DNA infection that has been related with numerous sicknesses and is the complete reason for basically all cervical malignancy cases. Almost 200 sorts of HPV have been described, and these sorts are named high-danger or generally safe relying upon their capability to cause destructive or generous injuries, individually. 4.5% of new disease cases overall are brought about by high-hazard HPV contamination, however generally safe sorts regularly show as moles. Basic moles (Verruca vulgaris) are by a wide margin the most common sort of mole, making up 70% of all non-genital cutaneous moles, and are believed to be amiable in nature.

Human skin is made out of two layers, the epidermis and the dermis, and HPV only focuses on the lowermost epidermal layer, the layer basale, to set up a tenacious disease, after which it captures the keratinocyte separation measure with the end goal of the beneficial viral life cycle. Correspondingly, HPV science varies in basal and suprabasal keratinocytes, the last of which are associated with various phases of epithelial separation . Keratinocytes make up 90% of every single epidermal cell, and bothers to their separation make the skin more helpless to contamination and illness. Presently, there is no remedy for HPV itself, and its treatment centers around the lightening of clinical indications until the disease is normally cleared by the insusceptible framework . Nonetheless, there is no convincing proof concerning whether the infection is totally dispensed with from the body or essentially brought down to imperceptible levels.

While much examination has been committed to the hereditary qualities of HPV-related malignancies, there is a deficiency of data concerning the hereditary foundation of non-genital cutaneous moles, which shows a squeezing need to more readily comprehend their etiology. Consequently, the point of the current examination is to give a genome-wide correlation of the transcriptomes of basic moles and ordinary skin utilizing cutting edge sequencing.

The current investigation served to explain the hereditary foundation of HPV contamination with regards to non-genital cutaneous moles. The discoveries of the current examination featured dysregulation of various qualities which may assume a basic part in mole development, including KRT16, EPGN, C15orf59, CYB561A3, and FCGRT. Moreover, a few insusceptible framework related pathways were discovered to be related with distinguished DE qualities including neutrophil degranulation, myeloid separation factor 88, and cost like receptors.

Unsere Daten legen außerdem nahe, dass einige an der Immunreaktion beteiligte Faktoren eine wichtige Rolle bei der Förderung des HPV-Infektionsprozesses spielen könnten. Tatsächlich zeigte die Analyse der Immunzellsignatur unterschiedliche Aktivitätsniveaus mehrerer mit dem Immunsystem verbundener Zellen, darunter NKT-, DC- und Treg-Zellen. Viele der Faktoren, die als an Immunzellen beteiligt identifiziert wurden, waren nicht Gegenstand früherer, auf Partnerbasis ausgewerteter Studien, was zukünftige Richtungen und Forschungslinien nahelegt, die sich auf diese individuellen Faktoren sowie die Expressionsmuster einzelner HPV-Typen konzentrieren.