Journal of Theoretical & Computational Science
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Abstrakt

Wie weit sind wir von der Natur entfernt? Analyse der Korrelationsähnlichkeiten zwischen Deskriptoren der Arzneimittelbank und Tripeptidmolekülen

Eitner K, Gawęda T, Koch U

Es wurde eine statistische Analyse der Ähnlichkeiten zwischen 2D-topologischen Deskriptoren aus der Moleküldatenbank der Arzneimittelbank und 8.000 Tripeptiden (alle möglichen Aminosäurekombinationen, die durch Nukleinsäuren kodiert werden) durchgeführt. Die Korrelation zwischen theoretisch berechneten Eigenschaften von Tripeptidmolekülen (MW, AlogP, topologische PSA, Wasserstoffbrückenspender und Wasserstoffbrückenakzeptoren) und topologischen Deskriptoren aus der Arzneimittelbank zeigte große Ähnlichkeiten zwischen einfachen Tripeptiden und Verbindungen mit spezieller Bioaktivität, die im Labor entwickelt wurden. Das Dokument präsentiert Histogramme für die Verteilung der Anzahl von Verbindungen mit ähnlichen Moleküleigenschaften, wie sie durch die Deskriptoren kodiert werden. Im Rahmen unserer Studie wurde eine einfache, innovative Methodik für die groß angelegte Analyse statistischer Daten und ihrer Korrelation entwickelt. Einige Hypothesen deuten darauf hin, dass hochverarbeitete Lebensmittel eine natürliche antibakterielle und antivirale Barriere darstellen. Unsere Forschung im Vergleich mit Literaturdaten beweist, dass viele Xenobiotika topologisch den natürlichen Metaboliten, die Tripeptide sind, ähnlich sind und einige ähnliche therapeutische Anwendungen haben.