Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik
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Abstrakt

Identifizierung von vier Polyhydroxyalkanoat-Strukturgenen in Synechocystis cf. salina PCC6909: In-silico-Beweise

Lucia Silvestrini, Bernhard Drosg und Ines Fritz

Polyhydroxyalkanoate (PHAs) sind eine Klasse von Biopolymeren, die auf natürliche Weise von Cyanobakterien synthetisiert werden und den Vorteil bieten, eine Alternative zu Kunststoffen auf petrochemischer Basis zu sein. Ihre vielseitige Anwendung in der Medizin, Landwirtschaft und Technik hat die Marktnachfrage erhöht, insbesondere aufgrund ihrer umweltfreundlichen Eigenschaften. Cyanobakterien besitzen ein hohes PHA-Produktionspotenzial, das auf genetischer und enzymatischer Ebene noch nicht gut bekannt ist. In dieser Arbeit haben wir die für die PHA-Produktion verantwortlichen Gene (phaA, phaB, phaE und phaC) in Synechocystis cf. salina PCC6909 (Syn.: Gloeothece membranacea) identifiziert, isoliert und sequenziert, für die bisher keine Genomdaten vorliegen. Anhand einer In-silico-Analyse veranschaulichen wir hier die Phylogenese der Pha-Proteine ​​(PhaA, PhaB, PhaE und PhaC) und die Vorhersage ihrer Struktur, d. h. sekundäre Faltung, Topologie, 3D-Modell und Spaltenlokalisierung. Unsere Ergebnisse werden im Kontext zukünftiger Anwendungen von Synechocystis cf. salina PCC6909 Pha-Genen zur heterologen PHA-Produktion und Stammverbesserung diskutiert.