Immunomforschung
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Abstrakt

IMGT, das internationale ImMunoGeneTics-Informationssystem: ein standardisierter Ansatz für Immungenetik und Immuninformatik

Marie-Paule Lefranc

IMGT, das internationale ImMunoGeneTics-Informationssystem®http://imgt.cines.fr, wurde 1989 vom Laboratoire d'ImmunoGénétique Moléculaire (LIGM) (Université Montpellier II und CNRS) in Montpellier, Frankreich, gegründet. IMGT ist eine hochwertige integrierte Wissensressource, die auf Immunglobuline (IG), T-Zell-Rezeptoren (TR), den Haupthistokompatibilitätskomplex (MHC) des Menschen und anderer Wirbeltiere sowie verwandte Proteine ​​des Immunsystems (RPI) aller Arten spezialisiert ist, die zur Immunglobulin-Superfamilie (IgSF) und zur MHC-Superfamilie (MhcSF) gehören. IMGT besteht aus fünf Datenbanken, zehn Online-Tools und mehr als 8.000 HTML-Seiten mit Webressourcen. IMGT bietet einen gemeinsamen Zugriff auf standardisierte Daten aus Genom, Genetik, Proteom und dreidimensionalen Strukturen. Die Genauigkeit und Konsistenz der IMGT-Daten basieren auf der IMGTONTOLOGIE, einer semantischen Spezifikation von Begriffen, die in der Immungenetik und Immunoinformatik verwendet werden. Die IMGT-ONTOLOGIE umfasst sechs Hauptkonzepte: IDENTIFIZIERUNG, KLASSIFIZIERUNG, BESCHREIBUNG, NUMEROTATION, ORIENTATION und OBTENTION. Basierend auf diesen Konzepten werden das kontrollierte Vokabular und die Annotationsregeln, die für die Identifizierung, Klassifizierung, Beschreibung und Nummerierung der immungenetischen Daten und für die Verwaltung des IMGT-Wissens erforderlich sind, in der wissenschaftlichen IMGT-Tabelle definiert. IMGT ist die internationale Referenz in Immungenetik und Immuninformatik für die medizinische Forschung (Repertoireanalyse der IG-Antikörperstellen und der TR-Erkennungsstellen bei Autoimmun- und Infektionskrankheiten, AIDS, Leukämien, Lymphomen, Myelomen), Veterinärforschung (IG- und TR-Repertoires bei Nutz- und Wildtierarten), Genomdiversitäts- und Genomentwicklungsstudien der adaptiven Immunantworten, Biotechnologie im Zusammenhang mit Antikörpertechnik (Einzelkettenfragmentvariable (scFv), Phagendisplays, kombinatorische Bibliotheken, chimäre, humanisierte und menschliche Antikörper), Diagnostik (Erkennung und Nachverfolgung von Resterkrankungen) und therapeutische Ansätze (Transplantationen, Immuntherapie, Vakzinologie). IMGT ist kostenlos verfügbar unter http://imgt.cines.fr.