Immuntherapie:Offener Zugang
Offener Zugang

Abstrakt

Immuntranskripte der Pazifischen Auster: Crassostrea gigas-Larven, deren Expression sich infolge einer Bakterienbelastung ändert

Jing Fang, Xiaohui Cai, Fengyi Mao, Hongyu Li, Honglin Chen, Minhua Qian, Jacob R. Hambrook, Patrick C. Hanington, Xinzhong Wu

Hintergrund: Meeresweichtiere, die in Gezeiten- und Mündungsgebieten leben, wie Austern, sind während ihrer Entwicklung zahlreichen Krankheitserregern ausgesetzt. Eine Infektion mit Bakterien wie Vibrio alginolyticus ist ein wichtiger Faktor, der die Larvenentwicklung beeinträchtigt und häufig zu einer hohen Sterblichkeit der Pazifischen Auster ( Crassostrea gigas) führt . Es ist bekannt, dass die Immunantwort der Auster eine wichtige Rolle beim Schutz des Tieres während der Entwicklung spielt, indem sie die Folgen einer Infektion abmildert.

Ergebnisse: In dieser Studie haben wir eine umfassende Analyse der Immunantwort von C. gigas- Larven auf eine Infektion mit V. alginolyticus durchgeführt . Wir haben das Transkriptom der C. gigas- Larve nach 0 Stunden sequenziert, d. h. nach der unbehandelten Austernlarve als Kontrolle sowie nach 6, 12, 24, 48 und 72 Stunden nach der Infektion. Nach der RNA-Sequenzierung sind die Rohdaten im NCBI Sequence Read Archive unter der Zugangsnummer PRJNA623063 verfügbar. Nach dem Filtern wurden insgesamt 58,24 Gb saubere Daten erstellt und unter Verwendung des Referenzgenoms von C. gigas zusammengesetzt . Die Verteilung der Qualität Q30 lag bei jeder Probe über 90,88 % und der GC-Gehalt lag zwischen 41,27 % und 42,91 %. Beim Vergleich mit Sequenzen in den Datenbanken COG, GO, KEGG, Swiss-Prot und NR wurden 1.267, 1.112, 2.187, 682, 1.133 differentiell exprimierte Gene gefunden, die 6, 12, 24, 48 bzw. 72 Stunden nach der Infektion annotiert wurden. Zahlreiche immunbezogene Gene zeigten eine differentielle Expression, die im Laufe der Zeit variierte: Toll-like-Rezeptoren, Tripartite-Motiv-Proteine, Lectin-ähnliche Faktoren, Scavenger-Rezeptoren, Signalwegkomponenten wie der Myeloid-Differenzierungsfaktor 88 und Stressproteine ​​wie das Hitzeschock-70-kDa-Protein waren nach einer Infektion mit V. alginolyticus alle häufiger vorhanden als in der Kontrollgruppe. Für die Analyse wurden diese Gene in mehrere Kategorien unterteilt, wie beispielsweise Mustererkennungsrezeptoren, Fibrinogen-ähnliche Proteine, schadensassoziierte molekulare Muster, Komplementfaktoren usw. Wir haben auch ursprünglich viele herunterregulierte immunbezogene Gene in C. gigas- Larven während der ersten 72 Stunden der Infektion entdeckt, wie beispielsweise TRIM2, TRIM45, TRIM56, TRIM71, Makrophagen-Mannose-Rezeptor 1, Apolipoprotein D, Cytochrom P450, Rho-bezogenes Protein, Stress-induziertes Protein 1, HSP68 , HSP75 , HSP70 B2, Häm-bindendes Protein 1, Häm-bindendes Protein 2, Schwermetall-bindendes Protein HIP, Hemicentin-1 usw. Diese allgemeinen Kategorien ermöglichten es uns, ein Immunantwortprofil für C. gigas während der ersten 72 Stunden der Infektion zu erstellen. Diese Ergebnisse weisen darauf hin, dass eine bakterielle Infektion ein komplexes Muster der Immungenexpression in C. gigas- Larven induziert.

Schlussfolgerung: Unsere Studie ermöglicht eine gezielte Untersuchung der Funktion spezifischer Immunfaktoren, die möglicherweise die Vielfalt und Evolution von Immunmolekülen bei Wirbellosen erklären und zur Entwicklung wirksamer Maßnahmen zur Leistungssteigerung der Austernzucht führen.