Immunomforschung
Offener Zugang

Abstrakt

Immuninformatischer Ansatz für einen epitopbasierten Peptidimpfstoff gegen das Lagos-Tollwutvirus-Glykoprotein G

Omar Hashim Ahmed, Arwa Abdelhalim, Sahar Obi, Khoubieb Ali Abd_elrahman, Ahmed Hamdi und Mohammed A.Hassan

Hintergrund: Das Lagos-Tollwutvirus gehört zur Gattung Lyssaviren, die für Meningoenzephalomyelitis bei Säugetieren verantwortlich sind, von der weltweit Millionen Menschen betroffen sind und die jedes Jahr Tausende von Todesfällen verursacht. Unseres Wissens nach gibt es noch keinen Peptidimpfstoff gegen das Lagos-Tollwutvirus. Der resultierende Peptidimpfstoff dürfte immunogener und weniger allergieauslösend sein als herkömmliche biochemische Impfstoffe. Ziel dieser Studie war die Entwicklung eines Insilco-Peptidimpfstoffs gegen das Lagos-Tollwutvirus unter Verwendung immuninformatischer Instrumente.
Methoden und Materialien: Sequenzen von Glykoprotein G des Lagos-Tollwutvirus wurden vom NCBI abgerufen, die abgerufenen Sequenzen wurden anschließend unter Verwendung verschiedener immuninformatischer Instrumente behandelt, damit B-Zellen die am besten konservierten Oberflächen- und Antigen-Epitope herausfinden und T-Zellen konservierte Peptide finden und ihre Bindungsaffinität an verschiedene MHC1- und MHC11-Allele testen können. Anschließend wurden eine Bevölkerungsabdeckungsanalyse und Homologiemodellierung für die vielversprechendsten Epitope durchgeführt, um ihre strukturellen Positionen in Glykoprotein G aufzuzeigen.
Ergebnisse und Schlussfolgerungen: Es wurden B-Zell-Tests für Bepipred mit 22 konservierten Epitopen durchgeführt, eine Emini-Oberflächenzugänglichkeitsvorhersage mit 12 konservierten Oberflächenepitopen und ein Kolaskar- und Tongaonkar-Antigenitätstest mit nur drei konservierten Epitopen, die antigen waren. 23 konservierte Epitope interagierten mit verschiedenen MHC-1-Allelen mit (IC50) ≤ 500, während 39 konservierte Epitope mit MHC-II-Allelen mit IC50 ≤ 1000 interagierten. Unter allen getesteten Epitopen auf Weltbevölkerungsabdeckung betrug die Bindung des Epitops FVGYVTTTF an sowohl MHC1- als auch MHC11-Allele 97,30 % und es wurde festgestellt, dass es 13 verschiedene Allele bindet, was auf ein starkes Potenzial für die Formulierung eines Peptidimpfstoffs gegen das Lagos-Tollwutvirus hindeutet.