Immunomforschung
Offener Zugang

Abstrakt

Immuninformatischer Ansatz – Entwicklung eines Impfstoffs mit mehreren Peptiden auf der Basis von Glykoprotein E des Herpes-simplex-Virus 3

Sahar Obi Abd Albagi, Safaa Hag Ahmed, Thana Eljozoli Mohamme, Esameldeen Ahmed Adam und Mohammed A Hassan

Hintergrund: Das Herpes-simplex-Virus (HSV) ist ein weit verbreiteter menschlicher Krankheitserreger, der Infektionen der orofazialen Schleimhäute (HSV-1) und der Genitalschleimhäute (HSV-2) verursacht. Eine produktive Infektion führt zur Bildung von Bläschenläsionen in den Schleimhautepithelien, gefolgt von einer Ausbreitung des Virus auf sensorische Neuronen und der Etablierung einer latenten Infektion, die ein Leben lang bestehen bleiben kann.
Material und Methode: Alle Sequenzen von Glykoprotein E [Humanes Herpesvirus 3] wurden vom NCBI bezogen und diese Sequenzen wurden IEDB-Vorhersagetools unterzogen, darunter eine Untersuchung auf B-Zellen und T-Zellen, wobei die B-Zelle mehreren Tests unterzogen wurde, wie z. B. Epitopenvorhersage, Oberflächenzugänglichkeit und Antigenitätsvorhersage; die T-Zelle umfasste MHC I- und MHC II-Vorhersagetools. Schließlich nutzten wir die Bevölkerungsabdeckung, um den höchsten Prozentsatz an Peptiden auszuwählen, die mit verschiedenen Allelen in Zusammenhang stehen.
Ergebnis: Wir haben einige Kandidatenpeptide als Impfstoff-abgeleitete Peptide aus dem B-Zell-Test erhalten, die den höchsten Wert bei der Emini-Oberflächenzugänglichkeit („DEDKLDTNSVYEPYYHSDHAESSWVNRGESSRKAYDHNSPYIWPRNDYDGF“) von 21,807 und „LKFVDTPESL“ mit einem Wert von 1,061 beim Kolaskar- und Tongaonkar-Antigenitätstest aufwiesen. Andererseits haben wir die höchste Affinität von Peptiden erhalten, die mit der Hauptabdeckung verschiedener Allele in MHC I („KAYDHNSPY“) und in MHC II („MWNYHSHVF“) interagierten.
Schlussfolgerung: Der Effizienz- und Sicherheitsgrad der durch computergestützte Untersuchungsmethoden vorhergesagten Kandidatenepitope muss durch Studien an Tiermodellen geschätzt werden, um zu prüfen, ob sie mit den zuvor genannten Eigenschaften eine gute Abwehrimmunantwort hervorrufen können oder nicht, und wir betrachten diese Studie als den ersten vielversprechenden Peptid-basierten Impfstoff gegen [Humanes Herpesvirus 3]-Glykoprotein E im Vergleich zu den vorherigen Studien.