Immunomforschung

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Offener Zugang

ISSN: 1745-7580

Abstrakt

Immuninformatische Vorhersage und Modellierung eines Cocktails aus B- und T-Zell-Epitopen aus Hüllglykoproteinen und Nukleokapsidproteinen des Sin Nombre Virus

Idris AB, Mahmoud SM, Mohamed Elamin S, Mustafa YY, Osman AA, Adam ME, Ali LB, Abbas MH, Abu-haraz AH, Abdelrahman KA und Salih MA

Das Sin-Nombre-Virus ist ein Erreger der Kategorie A mit einer gemeldeten Sterblichkeitsrate von 30 % bis 50 %. Es war für den Ausbruch im Yosemite-Nationalpark 2012 verantwortlich. Bislang ist keine spezifische Therapie zur Behandlung von HCPS verfügbar, das durch SNV verursacht wird. Trotz zahlreicher Bemühungen, sichere und wirksame Impfstoffe gegen SNV zu entwickeln, darunter konventionelle Ansätze sowie molekulare Impfstoffansätze, gibt es bis heute keine Impfstoffe, die sich als hochwirksam gegen SNV erweisen. In unserer Studie analysierten wir das Hüllglykoprotein und das Nukleokapsid von SNV mithilfe von Immuninformatik-Tools aus IEDB-Ressourcen, um die am besten konservierten und immunogensten Epitopen für B- und T-Zellen zu bestimmen. Dann wurden die vorhergesagten Epitopen auf die Bevölkerungsabdeckung gegenüber der gesamten Weltbevölkerung mit den auf MHC-I und MHC-II beschränkten Allelen untersucht. Unter den vorhergesagten Epitopen für B-Zellen waren die Epitope 743CKKYAYPWQT752 und 271QVDESKVS278 die besten Kandidaten für Glykoprotein und Nukleokapsid. Für die vorhergesagten Epitope für Glykoprotein CD8+ T-Zellen wurden die Epitope 208MTLPVTCFL216 und 458YTFTSLFSL466 ausgewählt. Interessanterweise waren die Epitope 25YILSFALPI133 und 239FLAARCPFL247 die besten Kandidaten für Nukleokapsid, da sie eine hohe Affinität zur Interaktion mit beiden MHC-Klassen I und II aufwiesen und weltweit eine hervorragende Populationsabdeckung für Klasse-I- und -II-Allele aufwiesen. Nach bestem Wissen hat unsere Studie zum ersten Mal einen Cocktail aus B- und T-Zell-Epitopen für die Entwicklung eines wirksamen Impfstoffs gegen HCPS vorhergesagt, der durch SNV verursacht wird.

Haftungsausschluss: Diese Zusammenfassung wurde mithilfe von Tools der künstlichen Intelligenz übersetzt und wurde noch nicht überprüft oder verifiziert.
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