Immunomforschung
Offener Zugang

Abstrakt

In-silico-Vorhersage eines Peptid-basierten Impfstoffs gegen das Geflügelpockenvirus (FPV)

Idris ST, Salih S, Basheir M, Elhadi A, Kamel S, Abd-elrahman KA, Hamdi A und Hassan MA

Das Geflügelpockenvirus (FPV) ist ein doppelsträngiges DNA-Virus und Mitglied der Familie der Poxviridae , das durch Aerosole und Insektenstiche übertragen wird und bei Geflügelpopulationen Haut- und Diphtherieinfektionen verursacht. Ziel dieser Studie war die Entwicklung eines Peptidimpfstoffs durch Auswahl aller möglichen Epitope nach Analyse aller in der NCBI-Datenbank gemeldeten FPV140-Proteinsequenzen mithilfe von In-silico -Ansätzen. Nach der Ausrichtung der abgerufenen Sequenz wurde die konservierte Region in das IEDB-Analysetool eingebracht, um B- und T-Zell-Epitope vorherzusagen. Anschließend wurde die Affinität der vorhergesagten Epitope zur Bindung an den Hühnerrezeptor (BF2*2101) (BF2*0401) für das MHC1-Molekül getestet. Peptide mit geringer Energie beim Andocken an den Rezeptor wurden als auf Epitopen basierender Impfstoff vorgeschlagen. Peptide (50 PPSPKP 55, 51 PSPKPL 56, 52 SPKPLP 57, 53 PKPLPK 58, 54 KPLPKS 59, 55 PLPKSK 60, 56 LPKSKQ 61 und 18 RPSSTV 23) waren die potenziellsten B-Zell-Epitope, während angedockte Epitope (110 YIMDNAEKL 118, 274 FYHRMYYPL 282, 278 MYYPLFSVF 286 231 YVVDNDRYV 239 und 317 LLSGVFLAY 325) aufgrund ihrer guten Bindungsaffinität als T-Zell-Epitope vorgeschlagen wurden, insbesondere das überlappende 110 YIMDNAEKL 118. Diese Studie kam zu dem Schluss, dass diese vorhergesagten Epitope nach In-vitro- und In-vivo- Studien zur Bewertung ihrer Wirksamkeit zur Herstellung eines guten Impfstoffs gegen FPV verwendet werden könnten.