ISSN: 2169-0138
Gomase VS und Kale KV
Das Alfalfa-Mosaikvirus (AMV) infiziert über 600 Pflanzenarten in 70 Familien (experimentelle und natürliche Wirte). Hüllproteine sind wichtige Materialien für die Herstellung von Struktur-Funktions-Korrelationen mit biologisch aktiven Peptiden auf physikochemischen und immunchemischen Ebenen und sind auch gute Modelle für die Beobachtung der evolutionären Veränderungen in Proteinmolekülen. Antigene Peptide an Position 1-MSSSQKKAGGKAGKPTKRSQN-21; 151-PTHAGMQNQNF-161; 22-YAALRKAQLPKPPALKVPVVKPT-44 des Hüllproteins des Alfalfa-Mosaikvirus eignen sich am besten für die Entwicklung von Untereinheitenimpfstoffen, da mit einem einzigen Epitop die Immunantwort in großen Populationen erzeugt werden kann. In dieser Forschung verwendeten wir PSSM- und SVM-Algorithmen zur Vorhersage von MHC-Klasse I- und II-Bindungspeptiden, Antigenität, Lösungsmittelzugänglichkeit sowie polaren und unpolaren Rückständen, um die Regionen zu analysieren, die wahrscheinlich auf der Oberfläche potenziell antigener Proteine freiliegen. Auf diese Weise können wir potenzielle Wirkstofftargets identifizieren und aktive Stellen gegen Infektionen sowie synthetische Peptidimpfstoffe entwickeln.