Transkriptomik: Offener Zugang
Offener Zugang

Abstrakt

Integration des Gen-Koexpressionsnetzwerks, GO-Anreicherungsanalyse zur Identifizierung der Genexpressionsignatur des invasiven Blasenkarzinoms

Hanaa Hibishy Gaballah

Das Blasenkarzinom ist die am weitesten verbreitete bösartige Erkrankung der Harnwege. Die Identifizierung genetischer Biomarker für die Invasivität des Tumors kann zu einer früheren Diagnose und einer angemessenen Behandlung beitragen. Die vorliegende Studie zielte darauf ab, ein Koexpressionsnetzwerk und eine GO-Anreicherungsanalyse zu integrieren, um Prognosemarker und Schlüsselgene zu identifizieren, die zur Entstehung und Progression von Blasenkrebs beitragen. Dazu wurde ein DNA-Microarray-Datensatz (GSE 37317) verwendet. Invasive und nichtinvasive Blasenkrebsgene wurden durch Anwendung eines gewichteten Gen-Koexpressionsnetzwerks, einer Genontologie und einer Pfadanalyse verglichen. Diese Studie identifizierte Kandidatengene (PURA, SRPK2, TRAK1, BRD2 und UPF3), die eine bedeutende Rolle bei der Progression und Invasivität des Blasenkarzinoms spielen könnten. Diese Marker könnten bei der Frühdiagnose der Muskelinvasivität von Blasenkrebs hilfreich sein. Abschließend sei gesagt, dass diese Erkenntnisse zu einem besseren Verständnis der molekularen Mechanismen der Progression und Invasivität von Blasenkrebs beitragen könnten.