ISSN: 2161-0398
Salam Pradeep Singh, Chitta Ranjan Deb, Lakhmi Nandan Kakati und Bolin Kumar Konwar
Das Enzym Fumarase katalysiert bekanntermaßen die stereospezifische Umwandlung von Fumarat in L-Malat, die Teil des Krebs-Zyklus ist. Trotz der biologischen Bedeutung und Wichtigkeit dieses Enzyms ist der Reaktionsmechanismus der Fumarase nicht vollständig verstanden oder bekannt. In diesem Zusammenhang wurde ein Experiment zur Molekulardynamiksimulation durchgeführt, das mindestens 10 Nanosekunden dauerte und mit dem in Discovery Studio 4.0 implementierten Programm Nano Scale Molecular Dynamics durchgeführt wurde. Die Trajektorienanalyse verschiedener Energieparameter ergab die thermodynamische Stabilität des Enzyms. Die vorliegenden Erkenntnisse können zum Verständnis der biologischen Bedeutung dieses Enzyms beitragen.