Mykobakterielle Erkrankungen
Offener Zugang
ISSN: 2161-1068
ISSN: 2161-1068
Prasanta Kumar Das*, Somtirtha B Ganguly und Bodhisatya Mandal
Hintergrund: Nukleinsäureamplifikationstechniken sind zu wichtigen Instrumenten bei der Diagnose verschiedener Krankheiten in klinischen Laboren geworden. PCR-Kontamination/Amplikon-Kontamination, die zu falsch positiven Ergebnissen führt, bleibt in diesen Laboren ein großes Problem. Die Verhinderung dieser Kontaminationen bei der Einrichtung dieser molekularbiologischen Labore war im Laufe der Jahre von entscheidender Bedeutung. Obwohl PCRs in geschlossenen Systemen die PCR-Kontaminationsraten erheblich senken, treten bei den herkömmlichen, auf Sonden basierenden Hybridisierungsmethoden aus verschiedenen Gründen weiterhin Kontaminationen auf.
Die Studie umfasste die Überprüfung der entscheidenden Parameter sowie der wahrscheinlichen Kandidaten, die die Kontamination in einer Umgebung mit hoher Belastung verursachen. Die Ermittlung der wirksamsten Maßnahmen zur Kontrolle von PCR-Kontaminationen für künftige Bemühungen hatte Priorität. Die Studie untersuchte die Wirksamkeit verschiedener Maßnahmensätze, die zur Reduzierung der Verunreinigungen beitrugen.
Materialien und Methoden: Die Erkennung der kontaminierenden PCR-Produkte oder Amplikons oder der kontaminierenden Organismen erfolgt mit den Genotype MTBDR plus V2-Kits (Hains Life Sciences) auf Grundlage der DNA-Streifentechnologie.
Ergebnisse: Durch die Reinigung vor und nach der Reinigung sowie durch die Reinigung der Arbeitsflächen konnte der durchschnittliche Kontaminationsprozentsatz um 36,5 % gesenkt werden. Die kombinierte Wirkung der Reinigung der Arbeitsflächen, der automatischen Pipettiergeräte und der AC-Maschinen mit ihren Filtern konnte den durchschnittlichen Kontaminationsprozentsatz auf 53,5 % senken und die Kontaminationsrate auf nahezu 94,6 % reduzieren (der durchschnittliche Kontaminationsprozentsatz lag beim Kontrolllauf bei 56,5 %).