Anästhesie und klinische Forschung
Offener Zugang

Abstrakt

Molekulares Docking und Analyse von In Silico generierten Liganden gegen SARSCoV-2 Spike- und Replikaseproteine

Ifeanyichukwu Okeke*, Cosmas Okeke

Mittels molekularem Docking wurde eine Bibliothek in silico generierter Liganden an SARS-CoV-2-Spike- und Replikaseproteine ​​angedockt, um Leitstrukturen zu identifizieren, die eine Neigung haben, diese Proteine ​​mit hoher Affinität zu binden. Die identifizierten Leitstrukturen binden diese Proteine ​​nachweislich mit stärkerer Affinität als die nativen Liganden und unterstützen so ihre Stoffwechselprozesse in vivo . Dabei wurde beobachtet, dass das Spike-Protein mit einer Affinität von -4,8 Kcal/mol an seinen zellulären Rezeptor bindet; an ein nicht-zelluläres Analogon bindet es mit -5,4, während 4twy 3BL und 5n19 D03 das Spike-Protein mit einer Affinität von jeweils -7,3 Kcal/mol binden. Sie binden außerdem das Replikaseprotein mit -8,2 bzw. -7,2 Kcal/mol. Die Ergebnisse deuten darauf hin, dass die identifizierten Liganden die Bindung der viralen Proteine ​​an ihre nativen endogenen Liganden bevorzugt verdrängen oder hemmen können und dass sowohl die Zellbindung durch Spike- und ACE2-Interaktion als auch der virale Replikationsprozess durch die Verwendung nur einer der identifizierten Substanzen gehemmt werden können. In der Studie wurden 5c8s G3A und 2d2d ENB als die am besten geeigneten Leads identifiziert, die sich günstig für die Erkennung des SARS-CoV-2-Spike-Proteins in biologischen Proben eignen, während 3d62 959 und 1r4l XX5 basierend auf den Filtern der Cheminformatik von SwissADME und Molinspiration als Leads mit der am besten geeigneten Arzneimittelähnlichkeit gegen SARS-CoV-2 identifiziert wurden und daher weitere In-vitro- und In-vivo -Bewertungen verdienen.