Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik
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Abstrakt

Molekulare Dockingstudien: Sollte der Erfolg die Zweifel überwältigen?

Shrivastava A

Die Leistungsfähigkeit des molekularen Dockings bei der Arzneimittelentdeckung darf nicht unterschätzt werden. Der Erfolg zahlreicher von der FDA zugelassener Medikamente gegen mehrere schreckliche Krankheiten hat die Geschwindigkeit der Arzneimittelentdeckung erhöht. Allerdings kann die inkonsistente Erfolgsbilanz des computergestützten Screenings Zweifel daran wecken, wie gut die Dockingmethoden die neuen chemischen Einheiten einstufen können. Wenn die Methode richtig untersucht wird, kann die Dockingmethode in der Lage sein, einen echten Liganden von einem falschen Liganden zu unterscheiden und zu klassifizieren.

Hier wurde die Leistung molekularer Dockingstudien anhand von Korrelationen experimenteller Bindungsaffinitäten von 3D-Liganden-Enzym-Komplexen von Bcr-Abl bewertet. Hier bewerten wir die Wirkung des Protein-Liganden-Komplexes mit den verschiedenen Bewertungsfunktionen und erklären, wie die Analoga mithilfe vorhandener rechnergestützter Ansätze besser gescreent werden können.

Diese Überprüfung und die Computerarbeit werden das Vertrauen der Computerbiologen sicherlich stärken.