ISSN: 2150-3508
Fayaz Ahmad, Khalid M Fazili, Tanveer A Sofi, Bashir A Sheikh, Ajaz A Waza, Rabiya Rashid und Tantry Tariq Gani
Die Studie berichtet über die Ergebnisse der molekularen Charakterisierung des Internal Transcribed Spacer (ITS) der ribosomalen DNA von drei monogenen Arten mittels Polymerase-Kettenreaktion (PCR), Nukleotidsequenzierung und Erstellung von phylogenetischen Bäumen von verschiedenen Fischwirten Kaschmirs. Die vorliegende Studie zeigt, dass die Größe des amplifizierten Produkts bei D. kashmirensis 873 bp, bei D. aegyptensis 1120 bp und bei D. guptai 687 bp beträgt, was auf intraspezifische Unterschiede in ihren Basenpaarlängen hinweist. Der Guanin- und Cytocin-Gehalt (G+C) von drei Diplozoon-Arten war bei drei Arten nahezu konstant, nämlich 47 % (D. kashmirensis), 47 % (D. aegyptensis) und 48 % (D. guptai). Dieser GC-Reichtum trägt zu den physikalischen Eigenschaften der RNA-Strukturen bei, da eine Korrelation zwischen dem GC-Gehalt und der optimalen Wachstumstemperatur besteht. Eine wichtige Beobachtung während der vorliegenden Studie war, dass Schizothorax niger von allen drei Arten der Diplozoidae infiziert ist: D. kashmirensis, D. aegyptensis und D. guptai. Beim gleichzeitigen Sammeln aller sechs Fische wurde jedoch nie Parasitismus durch eine der Parasitenarten beobachtet. Die phylogenetischen Bäume Maximum Parsimony (MP), Maximum Likelihood (ML) und Neighbor Joining (NJ) zeigten, dass D. kashmirensis und D. aegyptensis einen gemeinsamen Wirt haben: Carassius carassius und S. niger.