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Abstrakt

Vorhersage eines Multi-Epitop-Peptid-Impfstoffs gegen das Sudan-Ebola-Virus mithilfe immuninformatischer Ansätze

Ahmed Hamdi Abu-haraz * , Khoubieb Ali Abd-elrahman, Mojahid Salah Ibrahim, Waleed Hassan Hussien, Mohammed Siddig Mohammed, Marwan Mustafa Badawi und Mohamed Ahmed Salih

Das Sudan-Ebola-Virus ist ein einzelsträngiges RNA-Genom mit negativem Sinn, das zur Familie der Filoviridae gehört und hämorrhagisches Fieber verursacht. Es gibt keine Behandlung oder Impfung dagegen. Ziel dieser Studie ist daher, einen Peptidimpfstoff zu entwickeln und dabei mithilfe immuninformatischer Ansätze das Glykoprotein aller SUDV-Stämme zu analysieren und die konservierte Region zu bestimmen, die weiter untersucht wird, um alle möglichen Epitope vorherzusagen, die als Peptidimpfstoff verwendet werden können. Insgesamt 21 Glykoproteine ​​des Sudan-Ebola-Virus aus der NCBI-Datenbank wurden ausgerichtet, um die Konservierung zu bestimmen und die Epitope mithilfe der IEDB-Analyseressource vorherzusagen. Drei Epitope wurden als Peptidimpfstoff für B-Zellen vorhergesagt (PPPPDGVR, ETFLQSPP, LQSPPIRE). Für T-Zellen zeigten vier Epitope eine hohe Affinität zu MHC-Klasse I (FLYDRLAST, IIIAIIALL, MHNQNALVC und RTYTILNRK) und eine hohe Abdeckung gegen den Sudan und die gesamte Weltbevölkerung. Außerdem gibt es in MHC-Klasse II vier Epitope, die mit den häufigsten MHC-Klasse-II-Allelen (FAEGVIAFL, FLRATTELR, FLYDRLAST und FVWVIILFQ) interagieren und eine hohe Abdeckung gegen Sudan und die gesamte Weltbevölkerung aufweisen. Wir empfehlen In-vivo- und In-vitro-Studien, um die Wirksamkeit dieser vorhergesagten Epitope als Peptidimpfstoff zu beweisen.