Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik
Offener Zugang

Abstrakt

MUTATER: Tool zur Einführung benutzerdefinierter positionsbasierter Mutationen in Protein- und Nukleotidsequenzen

Azeem Mehmood Butt und Asifa Ahmed

MUTATER ist ein innovatives computergestütztes Tool, das für die Erstellung benutzerdefinierter Mutationen in Protein- und Nukleotidsequenzen entwickelt wurde. Es kann sowohl mit Protein- als auch mit Nukleotidsequenzen arbeiten, und in beiden Fällen werden die Eingaben vom Benutzer im RAW-Format vorgenommen. Anschließend muss der Benutzer die Position der Mutation und die Aminosäure-/Nukleotidänderung definieren, die an dieser bzw. diesen spezifischen Position(en) in den Sequenzdateien erforderlich ist. Die Ausgabe wird in einem Feld mit einer Option zum Speichern der neu erstellten Sequenzdatei angezeigt und zeigt auch die vorgenommenen Änderungen in einem separaten Änderungsfeld an. Somit dient es als grundlegendes, aber völlig neuartiges und einzigartiges Tool zum Erstellen von Mutationen und Änderungen in Sequenzdateien. MUTATER wurde in C# entwickelt, ist vollständig mit Windows-basierten PCs kompatibel und kostenlos auf der Website verfügbar. http://sites.google.com/site/mutater/