Transkriptomik: Offener Zugang
Offener Zugang

Abstrakt

Darstellung und Expressionsanalysen von Chalkonsynthase (CHS)- und Anthocyanidinsynthase (ANS)-Genen in Clivia miniata

Meerow AW

Chalkonsynthase (CHS) und Anthocyanidinsynthase (ANS) gehören zu den Schlüsselproteinen, die für die
Produktion von Anthocyanen in Pflanzen verantwortlich sind. Sie werden im Allgemeinen von Multisequenzfamilien kodiert, wobei einige Mitglieder
dieser Familien zur Farbpigmentierung beitragen. Die Studie untersuchte CHS- und ANS-Sequenzen in Clivia
miniata, deren Blütengewebe Farbveränderungen durchläuft. Die RNA zu cDNA wurde aus Pflanzengewebe isoliert
und drei Unigene (CmiCHS 11996, CmiCHS 43839 und CmiANS) mit kurzen Sequenzlängen wurden zunächst
unter Verwendung einer Sequenzierungsmethode erhalten. Sequenzspezifische Studien wurden aus den unveröffentlichten
kurzen Sequenzen von CHS und ANS erstellt. Die Länge der optimierten cDNA nach PCR betrug CmiCHS 11996
(933 bp), CmiCHS 43839 (951 bp) und CmiANS (983 bp). Zunächst wurde eine Interpretation des ORF-Formats vorgenommen,
indem das erwartete Protein mit 390 Aminosäuren (AEN04070) für CHS-Eigenschaften
und mit 355 Aminosäuren für ANS-Eigenschaften (AGD99672) verglichen wurde. In-silico-Analysen ergaben, dass das
berechnete subatomare Gewicht und der hypothetische isoelektrische Punkt (pI) von CmiCHS 11996 und CmiCHS43839
31,0 kDa – 6,95 bzw. 34,6 kDa – 7,54 betrugen. Die wichtigen Themen der Produktlimitierungsstelle und der aktiven Stelle
konnten anhand der berechneten Aminosäuresequenzen leicht identifiziert werden. Verschiedene Gruppierungsanalysen zeigten
, dass die CmiCHS- und CmiANS-Sequenzen sehr gut erhalten blieben und eine hohe Gruppierungseigenschaft
(> 83 %) mit Chalkonsynthasen aus anderen Pflanzen teilten. Es wurde jedoch eine weitere Studie durchgeführt, um
die Expressionsprofile dieser Gene in verschiedenen Geweben sowie den Blütenhüllblättern (orangefarbene und gelbe Blüten) unter Verwendung
der kontinuierlichen quantitativen PCR zu bestimmen. Die Expressionsniveaus von CmiCHS und CmiANS waren in den Blütenhüllblättern höher als
in anderen Geweben (Blätter, Stiel und Stiel sowie Blütenschaft). Diese Expressionsmuster der Gene in den Geweben
wurden mit der Ansammlung von Anthocyan verglichen, was darauf hindeutet, dass die orangefarbenen und gelben Farbverläufe eindeutig
mit der Regel der Chalkonsynthase und Anthocyansynthase in Zusammenhang stehen.