Anurag Anand
Durchsatzsequenzierungsstudien und neue Softwaretools revolutionieren die Analyse mikrobieller Gemeinschaften, doch die Vielfalt der experimentellen und computergestützten Methoden kann entmutigend sein. In dieser Übersicht diskutieren wir einige der verschiedenen Ansätze zur Erstellung von Gemeinschaftsprofilen und heben Stärken und Schwächen verschiedener experimenteller Ansätze, Sequenzierungsmethoden und Analysemethoden hervor. Wir gehen auch auf eine Schlüsselfrage ein, die sich aus verschiedenen Projekten zum menschlichen Mikrobiom ergibt: Gibt es einen wesentlichen Kern häufig vorkommender Organismen oder Abstammungslinien, den wir alle teilen? Es scheint, dass in einigen Lebensräumen des menschlichen Körpers, wie etwa in der Hand und im Darm, die Diversität zwischen den Individuen so groß ist, dass wir die Möglichkeit ausschließen können, dass eine Art in allen Individuen in hoher Häufigkeit vorkommt: Es ist möglich, dass der Fokus stattdessen auf höherstufigen Taxa oder auf funktionellen Genen liegen sollte.