ISSN: 1745-7580
Huynh-Hoa Bui, Jason Botten, Nicolas Fusseder, Valerie Pasquetto, Bianca Mothe, Michael J Buchmeier und Alessandro Sette
Hintergrund: Arenaviren sind eine Familie von Nagetierener Viren, die verschiedene hämorrhagische Fieber verursachen. Diese Krankheiten können verheerend sein und sind oft tödlich. Um die Entwicklung und Entwicklung von Diagnostika, Behandlungen und Impfstoffen für Arenavirusinfektionen zu unterstützen, haben wir eine Datenbank mit Proteinsequenzen der sieben pathogenen Arenaviren (Junin, Guanarito, Sabia, Machupo, Whitewater Arroyo, Lassa und LCMV) entwickelt. Ergebnisse: Die Datenbank enthält derzeit einen nicht redundanten Satz von 333 Proteinsequenzen, die manuell annotiert wurden. Alle Einträge wurden mit NCBI verknüpft und PubMed-Referenzen zitiert. Die Datenbank verfügt über eine praktische Abfrageoberfläche einschließlich BLAST-Suche. Es wurden auch Sequenzvariabilitätsanalysen durchgeführt und die Ergebnisse werden in der Datenbank gehostet. Schlussfolgerung: Die Datenbank ist unter http://epitope.liai.org:8080/projects/arena verfügbar und kann zur Unterstützung von Studien verwendet werden, die proteomische Informationen über pathogene Arenaviren erfordern.