Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik
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Abstrakt

Proteomische Analyse von Muscheln, die frischem und verwittertem Prestige- Öl ausgesetzt waren

Itxaso Apraiz, Giulia Leoni, David Lindenstrand, Jan-Olov Persson und Susana Cristobal

Biomonitoring-Programme, die Muscheln zur Bewertung der Wasserqualität weltweit verwenden, könnten von der Verwendung von Proteomik-Techniken profitieren. Diese könnten eingesetzt werden, um Proteinexpressionssignaturen der Belastung durch Verschmutzung zu erhalten, die weiter zu Vorhersagezwecken verwendet werden könnten. Dies würde erfordern, dass eine Kombination aus univariaten und multivariaten statistischen Analysen von Proteomik-Daten verwendet würde, um robuste Modelle zu erhalten. Wir zeigen eine Anwendung dieses Ansatzes an Muscheln, die frischem und verwittertem Treibstoff in einem Laborexperiment ausgesetzt waren, bei dem versucht wurde, die Auswirkungen der Ölpest der Prestige nachzuahmen. Durch die Kombination dieser statistischen Analysen wurde eine Reihe von Proteinflecken ausgewählt, die zur Klassifizierung von Muscheln verwendet werden könnten, die den beiden Arten von Heizöl ausgesetzt waren. Als Beispiel für die Möglichkeiten, die dieser Ansatz für Biomonitoring-Programme bieten könnte, wurden Muscheln an zehn Probenahmestationen entlang der Nordwest- und Nordostküste der Iberischen Halbinsel gesammelt und ihre Proteinexpressionsmuster überwacht.