Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik
Offener Zugang

Abstrakt

Proteomik-basierte Entwicklung von Biomarkern für Prionenerkrankungen

Bo-Yeong Choi, Yeong Seon Lee, Young Ran Ju, Chi-Kyeong Kim und Su Yeon Kim

Wir analysierten das proteomische Profil von ME7-Scrapie-infizierten Mäusegehirnen sowie die Interaktionen und Funktionen ausgewählter differentiell exprimierter Proteine, um potenzielle neue Biomarker zu identifizieren, die für die Diagnose von Prionenerkrankungen anwendbar sind. Mäuse wurden intrazerebral mit 10 % Homogenat von ME7-Scrapie-infizierten Mäusegehirnen inokuliert und auf neurologische Symptome überwacht. Wir suchten mithilfe eindimensionaler Gelelektrophorese und Flüssigchromatographie-Massenspektrometrie nach Proteinen, die in infizierten Gehirnproben spezifisch exprimiert werden. 317 Proteine ​​wurden anhand ihrer Peptidwerte und Verhältniswerte ausgewählt. Die wichtigsten identifizierten biologischen Prozesse waren zelluläre und metabolische Prozesse, Lokalisierung und Transport. Ausgewählte Proteine ​​hatten Funktionen im Zusammenhang mit neurologischen Prozessen, einschließlich Zell-Zell-Signalisierung, Übertragung von Nervenimpulsen und synaptischer Übertragung. Wir analysierten infizierte Wirtszellen mithilfe experimenteller und rechnergestützter Methoden und fanden viele signifikante Veränderungen der Proteinexpression. Wir identifizierten 43 Kandidatenproteine ​​mit hohen Peptidwerten und Verhältniswerten. Von diesen waren 36 potenzielle Kandidatenproteine ​​mit hochregulierten biologischen Prozessen und 7 mit herunterregulierten biologischen Prozessen verbunden. Wir haben das Vorhandensein von zwei dieser unterschiedlich exprimierten Kandidatenproteine ​​mittels Immunblot bestätigt.