Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik

Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik
Offener Zugang

ISSN: 0974-276X

Abstrakt

Bereichsdiagramme zur Übereinstimmung in Messvergleichsstudien, mit Anwendung zur Wiederholung von Massenspektrometrie-Experimenten

James A. Koziol, Anne C. Feng, Jingyi Yu, Noelle M. Griffin und Jan E. Schnitzer

Bei der Durchführung von Replikationsmessungen der Massenspektrometrie ist es wichtig, die Reproduzierbarkeit von Rohdaten der Massenspektrometrie (MS) wie Spektralzählung, Peptidzahl und Ionenintensitätswerte zu untersuchen. Die Reproduzierbarkeit kann aus diesen Replikationsdaten entweder formal mit Varianzanalysetechniken oder informell mit grafischen Verfahren, insbesondere Bland-Altman-Diagrammen bei gepaarten Läufen, abgeleitet werden. In dieser Anmerkung schlagen wir Bereichsdiagramme vor, um eine geeignete Verallgemeinerung von Bland-Altman-Diagrammen auf Experimente mit mehr als zwei Replikationsläufen zu ermöglichen. Wir beschreiben Bereichsdiagramme und ihre Interpretation und veranschaulichen ihre Verwendung mit Daten aus einer aktuellen proteomischen Studie zur markierungsfreien Analyse.

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