Immunomforschung
Offener Zugang

Abstrakt

Ribosomale Protein-mRNAs werden während der Aktivierung menschlicher dendritischer Zellen durch LPS translationsreguliert

Maurizio Ceppi, Giovanna Clavarino, Evelina Gatti, Enrico K. Schmidt, Aude de Gassart, Derek Blankenship, Gerald Ogola, Jacques Banchereau, Damien Chaussabel

Hintergrund: Dendritische Zellen (DCs) sind die Wächter des Immunsystems von Säugetieren und zeichnen sich durch einen komplexen Reifungsprozess aus, der durch die Erkennung von Krankheitserregern gesteuert wird. Obwohl in mehreren Studien die Analyse aktivierter DCs durch Transkriptionsprofilierung beschrieben wurde, deuten neuere Erkenntnisse darauf hin, dass mRNAs auch auf translationaler Ebene reguliert werden. Eine systematische Analyse der mRNAs, die in verschiedenen Stadien der DC-Aktivierung translational reguliert werden, wurde mithilfe der Translationsprofilierung durchgeführt, die die Saccharosegradientenfraktionierung polysomal gebundener mRNAs mit einer DNA-Microarray-Analyse kombiniert. Ergebnisse: Gesamt- und polysomal gebundene mRNA-Populationen, die aus unreifen, 4 h und 16 h alten, LPS-stimulierten humanen Monozyten-abgeleiteten DCs isoliert wurden, wurden auf Affymetrix Microarrays U133 2.0 analysiert. Eine Gruppe von 375 Transkripten wurde während der DC-Aktivierung als translationsreguliert identifiziert. Neben mehreren biochemischen Pfaden im Zusammenhang mit der Immunität war die Proteinbiosynthese selbst die statistisch relevanteste biologische Funktion, die unter den translationsregulierten mRNAs identifiziert wurde. Wir haben eine Gruppe von 11 großen mRNAs für Ribosomenproteine ​​identifiziert, die sich im späten Reifezeitpunkt von den Polysomen lösen, was auf die Existenz einer negativen Rückkopplungsschleife hindeutet, die die Translation in DCs reguliert und ribosomale Proteine ​​mit der immunmodulatorischen Funktion verbindet. Schlussfolgerung: Unsere Beobachtungen unterstreichen die Bedeutung der Translationsregulierung während der Immunantwort und könnten die Identifizierung neuer Proteinnetzwerke erleichtern, die für die Immunität relevant sind. Unsere Studie liefert auch Informationen über das mögliche Fehlen einer Korrelation zwischen Genexpression und Proteinproduktion für bestimmte in DCs vorhandene mRNA-Moleküle.