Arzneimitteldesign: Offener Zugang

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Offener Zugang

ISSN: 2169-0138

Abstrakt

Sensible quantitative Vorhersagen von MHC-bindenden Peptiden und fragmentbasierten Peptidimpfstoffen aus Trichinella spiralis

Gomase VS und Chitlange NR

Trichinella spiralis ist ein Fadenwurmparasit, der bei Ratten, Schweinen, Bären und Menschen vorkommt und für die Krankheit Trichinellose verantwortlich ist. Peptidfragmente von Antigenproteinen können verwendet werden, um Nonamere für die rationale Impfstoffentwicklung auszuwählen und das Verständnis der Rolle des Immunsystems bei Infektionskrankheiten zu verbessern. Analysen zeigen, dass MHC-Klasse-II-bindende Peptide des Antigenproteins von Trichinella spiralis wichtige Determinanten für den Schutz vor parasitären Infektionen in Wirtsform sind. In diesem Test verwendeten wir PSSM- und SVM-Algorithmen für die Antigenentwicklung und prognostizierten die Bindungsaffinität des Antigenproteins mit 439 Aminosäuren, das 432 Nonamere aufweist. Die Vorhersage der Bindungsfähigkeit von Antigenpeptiden an Moleküle des Haupthistokompatibilitätskomplexes (MHC) Klasse I und II ist für die Impfstoffentwicklung gegen Trichinella spiralis wichtig.

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