Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik

Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik
Offener Zugang

ISSN: 0974-276X

Abstrakt

Einzelzell-Epigenomik: Ein Überblick

Usman-Sani

Die Epigenomik einzelner Zellen umfasst sensibles epigenetisches Profiling, Einzelzellisolation und Barcoding sowie Hochdurchsatzsequenzierung, um epigenetische Szenarien bei Partnern einzelner Zellen zu charakterisieren. Die Einzelzell-Bisulfitsequenzierung beschreibt die Methylierungsszenarien seltener oder möglicherweise heterogener Zellpopulationen. Einzelzell-ATAC-Seq (Test auf transposasefähiges Chromatin mit Hochdurchsatzsequenzierung) und Einzelzell-Hi-C ermöglichen die Beschreibung der Variabilität in lokalen und globalen physikalischen Eigenschaften einzelner Chromosomen. Eine unvollständige epigenomische Integration pro Einzelzelle kann durch eine Erhöhung der Probengröße, durch computergestützte Zuordnung fehlender Merkmale oder durch
Verwendung der Referenzpopulationsepigenomik zur Bewertung epigenetischer Streuungen in vordefinierten Gruppen von Loci ausgeglichen werden.

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