Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik

Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik
Offener Zugang

ISSN: 0974-276X

Abstrakt

SiRNA Scanner - Ein auf Fuzzy-Logik basierendes Tool für das Design von RNA mit kleinen Interferenzen

Vijayakumar Saravanan und Piramanaygam Shanmughavel

Die Entdeckung kurzer interferierender RNA hat die Entwicklung einfacher, regulierter Methoden zur Unterbrechung der Genexpression ermöglicht . Da diese Methode jedoch immer beliebter wird, kann die Entwicklung wirksamer siRNA eine Herausforderung sein. Daher haben wir siRNA Scanner entwickelt, ein siRNA-Auswahlprogramm, das kleine interferierende RNA automatisch aus den vorliegenden RNA-Sequenzen auswählt. siRNA Scanner verwendet ein auf Fuzzy-Logik basierendes System zur Berechnung der siRNA-Qualitäten. Dieses Programm ist vollständig in Practical Extract Report Language (PERL 5.8.8.6 Build 820) erstellt und über eine Befehlszeilenschnittstelle zugänglich. Die hohe Leistung, die minimale Benutzerinteraktion und der schnelle Algorithmus von siRNA Scanner machen dieses Programm nützlich für die Auswahl kleiner interferierender RNA für Genexpressionsstudien.

Haftungsausschluss: Diese Zusammenfassung wurde mithilfe von Tools der künstlichen Intelligenz übersetzt und wurde noch nicht überprüft oder verifiziert.
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