Fortschritte in der pädiatrischen Forschung
Offener Zugang

Abstrakt

Räumlich-zeitliche Evolutionsdynamik von Norovirus GII.4-Varianten

Ruta Kulkarni, Atul M. Walimbe, Shobha D. Chitambar

Hintergrund: Noroviren (NoVs) sind weltweit die zweithäufigste Ursache für sporadische Gastroenteritis im Kindesalter. NoVs des GII.4-Genotyps sind global vorherrschend und unterliegen einer kontinuierlichen Evolution im VP1-Gen, das das wichtigste Kapsidprotein kodiert, was zur Entstehung neuer Varianten führt, wobei bisher 14 GII.4-Varianten identifiziert wurden. Methoden: Die vorliegende Studie untersuchte die räumlich-zeitliche Evolutionsdynamik der global zirkulierenden GII.4-NoVs mithilfe eines Bayes-Ansatzes sowie phylogeografischer und Migrationsmusteranalysen anhand eines Datensatzes vollständiger VP1-Sequenzen, die jede der GII.4-Varianten repräsentieren. Ergebnisse: Die geschätzte mittlere Evolutionsrate für GII.4 VP1 betrug 5,1 x 10-3 Nukleotidsubstitutionen pro Stelle pro Jahr (Sub/Stelle/Jahr), die Zeit bis zum jüngsten gemeinsamen Vorfahren (tMRCA) betrug ~1971 ​​und der wahrscheinlichste Ursprungsort waren die Vereinigten Staaten von Amerika (USA). Die vierzehn bekannten GII.4-Varianten zeigten unterschiedliche Evolutionsraten (4,5–7,4 x 10-3 Sub/Site/Jahr) und tMRCA (~1984 bis ~2006), wobei die Mehrheit der Varianten ursprünglich aus den USA/Asien stammte. Die Analyse der Migrationsmuster wies auf die wichtige Rolle Australien-Neuseelands, Indiens und Südeuropas bei der weltweiten Verbreitung von GII.4-Noroviren hin. Schlussfolgerung: Die Studie trägt zum Verständnis der Evolutionsdynamik des GII.4-Norovirus bei.