Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik

Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik
Offener Zugang

ISSN: 0974-276X

Abstrakt

Standardisierung von Proteomikdaten – die Arbeit der HUPO Proteomics Standards Initiative

Sandra Orchard und Henning Hermjakob

Die Initiative HUPO Proteomics Standards hat sich in den letzten sechs Jahren der Entwicklung und Implementierung gemeinsamer Standards für Datenberichterstattung und -austausch gewidmet, die die Übertragung von Proteomikdaten vom Ersteller zum Mitarbeiter in ein endgültiges öffentliches Archiv unmittelbar vor der Veröffentlichung ermöglichen. Die Benutzergemeinschaft profitiert nun von dieser Arbeit, da XML-Formate zum Austauschen und Importieren von Daten in Datenbanken verwendet werden, wodurch unabhängig von der ursprünglichen Instrumentierung direkter Zugriff und Vergleichbarkeit möglich sind. Öffentliche Repositorien ermöglichen es Forschern nun, veröffentlichte experimentelle Daten anzuzeigen und zu durchsuchen, und Referenzdatensätze werden für Benchmarking-Zwecke verfügbar. Durch die Zusammenarbeit zwischen Datenbanken werden diese Datensätze einem immer größeren Publikum zugänglich gemacht und es können aus vorhandenen Daten spannende neue wissenschaftliche Erkenntnisse gewonnen werden.

Haftungsausschluss: Diese Zusammenfassung wurde mithilfe von Tools der künstlichen Intelligenz übersetzt und wurde noch nicht überprüft oder verifiziert.
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