ISSN: 0974-276X
Sandra Orchard und Henning Hermjakob
Die Initiative HUPO Proteomics Standards hat sich in den letzten sechs Jahren der Entwicklung und Implementierung gemeinsamer Standards für Datenberichterstattung und -austausch gewidmet, die die Übertragung von Proteomikdaten vom Ersteller zum Mitarbeiter in ein endgültiges öffentliches Archiv unmittelbar vor der Veröffentlichung ermöglichen. Die Benutzergemeinschaft profitiert nun von dieser Arbeit, da XML-Formate zum Austauschen und Importieren von Daten in Datenbanken verwendet werden, wodurch unabhängig von der ursprünglichen Instrumentierung direkter Zugriff und Vergleichbarkeit möglich sind. Öffentliche Repositorien ermöglichen es Forschern nun, veröffentlichte experimentelle Daten anzuzeigen und zu durchsuchen, und Referenzdatensätze werden für Benchmarking-Zwecke verfügbar. Durch die Zusammenarbeit zwischen Datenbanken werden diese Datensätze einem immer größeren Publikum zugänglich gemacht und es können aus vorhandenen Daten spannende neue wissenschaftliche Erkenntnisse gewonnen werden.