Immunomforschung
Offener Zugang

Abstrakt

The Structure and Evolution of Beta-Rhizobial Symbiotic Genes Deduced from Their Complete Genomes

Zheng JZ, Wang R, Liu RR, Chen JJ, Wei Q, Wu XY, Pang XW, James EK und Liu XY

Zusammenfassung Stickstofffixierende Rhizobien wurden vor mehr als 100 Jahren entdeckt. Sie werden in zwei Kladen eingeteilt, Alpha- und Beta-Rhizobien. Ihre symbiotische Funktion ist bemerkenswert, aber ihr Ursprung und ihre Entwicklung waren aus phylogenetischer Sicht verwirrend. In dieser Studie verwenden wir 33 öffentlich verfügbare vollständige Genomsequenzen, die von NCBI heruntergeladen wurden und aus Bakterien und Archaeen bestehen, und konzentrieren uns auf 10 Stämme, für die wir symbiotische Strukturkarten auf der Grundlage ihrer Genome und früherer Genanmerkungen erstellen. Es wurden Phylogenien der für die Symbiose essentiellen Gene nodA und nifH untersucht. Obwohl in der vorliegenden Studie große Unstimmigkeiten mit einigen Hypothesen aus früheren Studien festgestellt wurden, unterstützen wir das allgemeine Konzept, dass Beta-Rhizobien die ursprünglichen Symbionten der Hülsenfrüchte waren, ihre symbotischen Gene jedoch von einem gemeinsamen Vorfahren der Alpha-Rhizobien stammen. Wir bestätigen außerdem, dass die Verbreitung und Aufrechterhaltung symbiotischer Gene hauptsächlich durch vertikale Übertragung erfolgte, wobei die laterale Übertragung eine bedeutende, wenn auch unterstützende Rolle spielte.