ISSN: 2169-0138
Azadi Golbamaki, Alessio M Franchi, Serena Manganelli, Alberto Manganaro, Giuseppina Gini und Emilio Benfenati
ToxDelta ist ein neues Tool zur Bewertung der Toxizität von Chemikalien, das auf einer modifizierten Version des fmcs_R-Pakets basiert. Zwei strukturell ähnliche Moleküle haben eine gemeinsame maximale Substruktur (MCS). Um zu bewerten, ob zwei ähnliche Moleküle unterschiedliche Wirkungen haben, haben wir unsere Aufmerksamkeit auf die Molekülfragmente gerichtet, die nicht in der MCS enthalten sind. Diese Teile können den Wert der Eigenschaft erhöhen oder verringern. Wir haben eine Variante des MCS-Konzepts der effizienten Relevanz bei der Toxizitätsbewertung in Betracht gezogen, bei der die Molekülringe nicht aufgebrochen werden dürfen. Um die Toxizität der Zielchemikalie zu bewerten, extrahiert ToxDelta die MCS und beschreibt die verbleibenden Fragmente. Jeder dieser Teile stellt einen Unterschied zwischen zwei Molekülen dar und seine Relevanz bei der Toxizitätsbewertung wird anhand einer wissensbasierten Liste aktiver und inaktiver Fragmente bewertet. ToxDelta berücksichtigt die Unterschiede der Moleküle in einem Read-Across-Ansatz.