Zeitschrift für Physikalische Chemie und Biophysik
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Abstrakt

Tryptophanrückstände aus dem Cap-Bindungsschlitz in Mitgliedern der eIF4E-Familie: Ihre Beiträge zu Zirkulardichroismus-Spektren im nahen UV

Joanna Zuberek* und Agnieszka Stelmachowska

eIF4E, ein Schlüsselfaktor bei der kappenabhängigen Translationsinitiierung, bindet die Kappenstruktur am 5'-Ende der mRNA durch Stapelinteraktion, an der zwei seiner acht konservierten Tryptophanreste beteiligt sind. In diesem Artikel haben wir die einzelnen Beiträge von Tryptophanresten zu den Nah-UV-Zirkulardichroismus-Spektren untersucht, um strukturelle Ähnlichkeiten und Unterschiede im Kappenbindungsmotiv unter den Mitgliedern der eIF4E-Familie zu ermitteln. Das Nah-UV-CD-Spektrum des menschlichen eIF4E1a in seiner Apo-Form, das hauptsächlich aus dem 1Lb-Übergang resultiert und von zwei vibrionischen Bändern dominiert wird, ist unter den eIF4Es konserviert. Basierend auf dem Vergleich der CD-Spektren für eIF4E-Mutanten haben wir gezeigt, dass die an der Stapelinteraktion beteiligten Tryptophane die stärksten einzelnen Beiträge liefern, was die Identifizierung ihrer unterschiedlichen Ausrichtung in Bezug auf die Kappe ermöglicht. Dies zeigt, dass Nah-UV-CD ein schnelles und leistungsstarkes Werkzeug zur Analyse der Tryptophankonformation in eIF4E-Proteinen und ihrer Änderungen bei der Bindung modifizierter Kappenanaloga ist.