Zeitschrift für klinische Studien
Offener Zugang

Abstrakt

Validierung von Referenzgenen für die Genexpressionsanalyse in der Fruchtentwicklung von Vaccinium bracteatum Thunb mittels quantitativer Echtzeit-PCR

Feng He*, Liangxian Gui, Yan Zhang, Bo Zhu, Xiaoping Zhang, Min Shen, Fengying Wan, Lu Yang, Jiaxin Xiao*

Hintergrund: Vaccinium bracteatum Thunb. (VBT) ist in den Bergregionen Ost- und Südchinas weit verbreitet. VBT-Blätter haben einen hohen medizinischen Wert und können zum Färben von Reis verwendet werden, um „Wumifan“ herzustellen. Seine Früchte enthalten ebenfalls viele Nährstoffe. Der Erforschung des molekularen Inhalts von VBT wurde jedoch bisher nur wenig Aufmerksamkeit gewidmet. Zuvor haben wir RNA-Sequenzierung an drei typischen VBT-Früchten durchgeführt, die sich in verschiedenen Reifestadien befanden, obwohl bei der Validierung ein zuverlässiges Referenzgen verloren ging.

Ergebnisse: In dieser Studie haben wir auf der Grundlage früherer Studien und Transkriptomanalysen zehn Kandidaten-Referenzgene ausgewählt. Anschließend wurden diese Gene mithilfe einer Kombination von Methoden, darunter geNorm, NormFinder und Bestkeeper, mit einer umfassenden Rangfolgebewertung bewertet. Als Ergebnis stellten wir fest, dass die Gene Actin2, NADH und ADK eine hohe Zuverlässigkeit für die Analyse der Expressionsniveaus von Genen aufweisen, die an der Fruchtentwicklung beteiligt sind. Darüber hinaus wurden die Transkriptniveaus von 15 DEGs aus der Transkriptomanalyse unter Verwendung von NADH als Referenzgen bewertet, und die RT-qPCR-Daten stimmten in hohem Maße mit den Transkriptomdaten überein.

Schlussfolgerungen: Diese Ergebnisse liefern ein zuverlässiges Referenzgen für weitere Studien der Genexpression, was für eine umfassende Erforschung von VBT von Vorteil sein wird.