Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik

Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik
Offener Zugang

ISSN: 0974-276X

Abstrakt

Visual Mass-Spec Share (vMS-Share): Ein neues öffentliches webbasiertes Repository für Massenspektrometrie-Visualisierung und Data Mining

Niksa Blonder, Benjamin C. Orsburn, Josip Blonder und Carlos A. Gonzalez

Hiermit stellen wir Visual Mass-Spec Share (vMS-Share) vor, ein neues öffentliches Massenspektrometrie-Repository (MS) und eine Data-Mining-Website/-Ressource, die unter https://vmsshare.nist.gov kostenlos zugänglich ist. vMS-Share ist eine webbasierte Anwendung, die für die sofortige Visualisierung von Roh-MS-Daten mit integrierter Anzeige von Metadaten entwickelt wurde und für den Austausch von experimentellen Ergebnissen aus den Bereichen Proteomik und Metabolomik optimiert ist. Jede MS-basierte Identifikation ist mit einem bestimmten Experiment verknüpft und die gesamten experimentellen Daten können dann über den Link angezeigt werden, der einem bestimmten Peptid und/oder kleinen Molekül zugeordnet ist. Dem Benutzer werden interaktive und benutzerfreundliche Visualisierungen über eine Vielzahl leicht zugänglicher Suchfilter zur Verfügung gestellt.

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